核心提示：来自索尔克研究所的研究人员已经将注意力集中在激活致癌基因的特定机制上，致癌基因是一种改变的基因，可以导致正常细胞变成癌细胞。

  来自索尔克研究所的研究人员已经将注意力集中在激活致癌基因的特定机制上，致癌基因是一种改变的基因，可以导致正常细胞变成癌细胞。这项工作提高了预测和解释癌症基因组中发现的哪些基因突变导致疾病的能力。

  当基因突变导致染色体以不同的方式分裂并融合在一起时，正常细胞就会癌变。在这张图片中，正常染色体(蓝色)与染色体(绿色和红色)被CRISPR-Cas9基因组工程改变并融合在一起。

  由细胞异常过度生长引起的癌症是世界上第二大死亡原因。来自索尔克研究所的研究人员已经将注意力集中在激活致癌基因的特定机制上，致癌基因是一种改变的基因，可以导致正常细胞变成癌细胞。癌症可能是由基因突变引起的，但特定类型的癌症，如破坏和重新连接DNA的结构变异，其影响可能相差很大。研究结果发表在2022年12月7日的Nature杂志，这些基因突变的活性取决于特定基因和调控基因序列之间的距离，以及相关调控序列的活性水平。

  这项工作提高了预测和解释癌症基因组中发现的哪些基因突变导致疾病的能力。

  “如果我们能更好地了解一个人患癌症的原因，以及哪些特定的基因突变导致了癌症，我们就能更好地评估风险，并寻求新的治疗方法，”索尔克医学科学家Jesse Dixon说，他是该论文的资深作者，也是基因表达实验室的助理教授。

  大多数基因突变对癌症没有影响，导致致癌基因激活的分子事件也相对罕见。Dixon的实验室研究了基因组在3D空间中的组织方式，并试图理解为什么这些变化会发生在某些情况下，而不是大多数情况下。该团队还想确定可能区分这些事件发生的地点和时间的因素。

  “基因就像一盏灯，调节它的东西就像电灯开关，”Dixon说。“我们看到，由于癌症基因组中的结构变异，有很多开关可以潜在地‘打开’特定的基因。”

  研究小组利用CRISPR-Cas9基因编辑技术，通过切割基因组某些位置的DNA引入基因突变。他们发现，他们创造的一些变异对附近基因的表达有重大影响，并最终可能导致癌症，但大多数基本上没有影响。当一些基因被带到具有新的调控序列的环境中时，它们似乎失去了控制，而另一些基因则完全没有受到影响。引入的序列类型似乎对细胞是否癌变有巨大的影响。

  “我们的下一步是测试基因组中是否有其他因素有助于致癌基因的激活，”索尔克博士后、该论文的共同第一作者Zhichao Xu说。“我们也对我们正在开发的一种新的CRISPR基因组编辑技术感到兴奋，这种技术可以使这种类型的基因组工程工作效率更高。”

  参考文献

  Structural variants drive context dependent oncogene activation in cancer