核心提示:研究结果表明,这些分类系统可应用于在分离和混合微生物样本中,检测鲍曼不动杆菌和肺炎克雷伯菌,构建以糖脂质谱为主的病原菌鉴定系统。
快速识别和鉴定致病菌的特征在临床治疗以及加快患者痊愈等方面起着重要作用。鉴于抗生素耐药菌株的传播速度飞快,尤为需要一种可快速检测、鉴定抗生素耐药菌的方法。
现今临床实验室中标准的病原菌鉴定方法主要包括:形态学鉴定和生化鉴定,以上方法却存在耗时长、结果不完整等缺点。随着FDA批准的Bruker MALDI
Biotyper和bioMérieux VITEK MS系统的实现,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF
MS)蛋白质指纹图谱作为病原体鉴定的主要方法并获得了普及。与传统方法相比,MALDI-TOF
MS平台功能强大,操作简单。但仍然需要对细菌细胞进行预培养,已获得特征单一的菌落;另外,MALDI-TOF
MS并不能区分混合微生物样本或不能从各类生物样本中直接鉴定出个中微生物。此外,FDA批准使用的平台并没有相关检测微生物耐药性的方法,而Bio-typer仅可用于科研中检测β内酰胺酶。为开发一种与基于蛋白质的MALDI-TOF
MS策略相补充的方法,前期研究可通过细菌糖脂质谱对多种多粘菌素耐药的菌株进行检测鉴定。

在本研究中,我们建立了一种机器学习的范式,通过收集48种革兰氏阳性和革兰氏阴性菌株的脂质谱,构建非自动管理数据集合,以鉴定鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯氏菌及其多粘菌素耐药相关菌株。研究结果表明,这些分类系统可应用于在分离和混合微生物样本中,检测鲍曼不动杆菌和肺炎克雷伯菌,构建以糖脂质谱为主的病原菌鉴定系统。
参考文献
1. Fondrie, W. E.; Liang, T.; Oyler, B. L.; Leung, L. M.; Ernst, R. K.; Strickland, D. K.; Goodlett, D. R., Pathogen Identification Direct From Polymicrobial Specimens Using Membrane Glycolipids. Scientific Reports 2018, 8 (1).