核心提示:在垃圾填埋场和渗滤液环境中,细菌的组成结构、耐药基因的横向水平传递以及元素循环过程可能受到噬菌体与其宿主的相互作用的调控,这进一步表明病毒也可能是垃圾分解过程的重要参与者。
城市固体废物填埋场是抗生素耐药性、病原体和病毒的重要来源,也是进行垃圾分解的微生物群的栖息地。病毒在城市生活垃圾分解和抗生素耐药基因传播等生态相互作用中具有重要意义。
卫生填埋是一种全球性的城市生活垃圾处理策略。但是,垃圾填埋场是病毒、耐药细菌、耐药基因等污染物的重要来源。污染物渗入附近环境,威胁当地的生态安全。垃圾渗滤液是垃圾填埋场渗滤的液体,由微生物群介导的生物降解过程产生,是直接研究垃圾填埋场微生物的一种实用样品。研究垃圾填埋场病毒群落结构和生态功能,可为垃圾填埋场微生物生态学和公共卫生提供理论知识。
噬菌体除了数量丰富外,其溶原性和溶菌性都会导致宿主受损,因此通过感染自上而下地控制细菌群落的数量和多样性。一些文献中报道了噬菌体作为生物因子导致原核生物群落组成总变异的40.6%,远高于非生物因子(14.5%),表明噬菌体在原核生物群落的形成中的必不可少性。同时,在其他领域如海洋、污染土壤和城市废水也研究了病毒参与生物地球化学循环和编码辅助代谢基因的功能。因此,分析病毒与宿主细菌在垃圾分解过程中的相互作用具有重要意义。
图1:病毒群落参与耐药基因传播及介导垃圾分解的示意图
在这项研究中,调查中国七个城市(成都、重庆、上海、深圳、长沙、唐山、广州)的填埋渗滤液中病毒群落结构和相关的驱动因素,病毒和它们的细菌宿主之间的联系,病毒相关的耐药基因传播以及病毒群落对城市固体废物的分解作用。这七个城市包括4个特大城市、2个大型城市和1个小型城市,代表了中国的渗滤液特征。
检测到的病毒多以噬菌体为主。渗滤液中噬菌体科以Siphoviridae、Myoviridae和Podoviridae(91.7 ± 3.6) %。它们的假定宿主是重要的城市垃圾分解者如乳酸菌、假单胞菌,梭状芽孢杆菌、蛋白菌和拟杆菌。
除了细菌宿主的直接影响外,pH值作为垃圾分解的关键参数,也是影响病毒组成的关键因素。另外,所鉴定的核心耐药基因的丰度显示出受人类活动(如人类粪便)影响。总之,在垃圾填埋场和渗滤液环境中,细菌的组成结构、耐药基因的横向水平传递以及元素循环过程可能受到噬菌体与其宿主的相互作用的调控,这进一步表明病毒也可能是垃圾分解过程的重要参与者。
参考文献
Lin, X., et al., Viral community in landfill leachate: Occurrence, bacterial hosts, mediation antibiotic resistance gene dissemination, and function in municipal solid waste decomposition. Sci Total Environ, 2022. 853: p. 158561.