毒素-抗毒素系统切割噬菌体RNA的宿主噬菌体防御
原创 发布时间:2023-03-08 浏览次数: 1136 来源: 黄智超

核心提示:流产感染是细菌宿主对噬菌体进行防御的一种典型的方式。流产感染,通过以牺牲被感染的细胞为代价,来防止噬菌体在细胞群体水平当中蔓延。


  流产感染是细菌宿主对噬菌体进行防御的一种典型的方式。流产感染,通过以牺牲被感染的细胞为代价,来防止噬菌体在细胞群体水平当中蔓延。这种群体水平的噬菌体防御被称为“流产感染”。常见的“流产感染”噬菌体防御系统如基于环寡核苷酸的抗噬菌体信号系统(CBASS)、逆转录酶防御系统等。它们之间的共同之处是在于都存在一个下游的效应基因,触发细胞膜发生变化进而导致宿主自身死亡,阻止噬菌体在群体水平上进行扩散。

  而这篇文章提到的毒素-抗毒素防御系统,是通过另一种流产感染的方式进行噬菌体防御。这个系统通常是由两个部分组成,一部分是抑制生长的毒素物质,另一部分是与其同源的抗毒素部分,在正常情况下,它们之间共同表达形成复合物,从而中和毒素。文章中介绍的毒素-抗毒素防御系统是一种III型的TA系统,抗毒素部分具有一部分的重复序列,而毒素基因编码的是一种核糖核酸内切酶,并且能够切割抗毒素前体产生与毒素结合的重复前体来中和毒性。


  文章鉴定的toxIN系统是属于III型毒素抗毒素系统的。当作者将系统中的两个部分在载体中单独进行克隆和诱导表达,来鉴定了两个部分的功能。结果显示,当诱导表达ToxN时,会导致细菌生长受到抑制,但是当两个部分同时诱导,则不会对细菌造成影响。此外,通过对细菌吸光值的测量,还发现在诱导了ToxN的三十分钟后,再对toxI进行诱导,仍然可以消除由ToxN引起的毒性。另外,作者发现toxIN这个系统能够对T2、T4等多个噬菌体进行防御,能够保护大肠杆菌免受噬菌体的感染。通过实验表明,当toxIN系统存在的条件下,T4噬菌体不能在宿主体内正常复制,并且通过比较用高浓度的噬菌体进行侵染实验,不管细菌有没有这个防御系统,在一轮噬菌体感染后,存活下来的细胞数量是相一致的。这也表明,toxIN系统是通过流产感染的方式来进行噬菌体防御的。


  由于目前已经知道了III型TA系统包含核酸酶,作者为验证ToxN的作用方式,通过转录组测序的方法进行了验证。作者选取的时间点是在诱导ToxN表达的5~10分中之后,因为在这段时间,诱导表达ToxN之后细菌的吸光值显著发生了变化。通过与对照组进行对比,其中一部分的切割比率发生了明显变化,过表达ToxN后,大部分基因的切割率都小于-1,这表示大部分的RNA已经被切割。而通过对这些切割的位点进行分析,发现所有的切割部分都含有GAAAU这一序列。并且,在统计中ToxN切割的转录物中,都能发现GAAAU的切割区域,在与对照组之间的切割比例统计发现,这一序列也呈现出很大的差异。另外,这段序列同时也是toxI中重复序列的一部分。因此作者判定,ToxN是针对GAAAU这一序列的特异性核酸酶。


  最终作者进一步验证,得出了III型TA系统的噬菌体防御机理图:当不含有防御系统时,噬菌体DNA注入宿主体内,开始进行噬菌体的转录、翻译,并对宿主的转录进行抑制,最终使宿主裂解并产生新的噬菌体颗粒;当含有防御系统时,噬菌体DNA注入宿主体内,抑制宿主的转录,同时抑制了toxI的转录,并导致ToxN核酸酶的释放,以讲解噬菌体的转录物,阻止成熟的噬菌体颗粒产生。


  参考文献

  [1] Guegler C K , Laub M T . Shutoff of host transcription triggers a toxin-antitoxin system to cleave phage RNA and abort infection[J]. Molecular Cell, 2021, 81(11).

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