北京新冠感染高峰期未见新变异株

2023-03-22 00:00:00
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核心提示:研究通过定期采集北京市新冠患者呼吸道样本,随机抽取样本进行分析,共获得2881条高质量SARS-CoV-2基因组序列。其中2022年11月14日到12月20日,共检测样本413份,90%为BA.5.2和BF.7。

  2023年2月8日,高福院士团队在《柳叶刀》杂志发表题为“Characterisation of SARS-CoV-2 variants in Beijing during 2022: an epidemiological and phylogenetic analysis”的最新研究成果。研究通过定期采集北京市新冠患者呼吸道样本,随机抽取样本进行分析,共获得2881条高质量SARS-CoV-2基因组序列。其中2022年11月14日到12月20日,共检测样本413份,90%为BA.5.2和BF.7。


  图1 2022年11月14日以来,本地病例和境外输入病例中奥密克戎亚变异毒株的采样和分布情况[1]

  2022年11月14日起,北京市新增确诊病例大幅增加,测序的413份样本中本地病例350份,境外输入病例63份(图1A)。其中,BF.7占265株(75.71%),11月14日后成为北京地区的优势株,BA.5.2 (57株[16.29%])、BA.5.1 (27株[7.71%])分列第二和第三位(图3B)。将本地感染分为门诊患者和住院患者,两组中优势株均为BF.7。本地和输入性感染在谱系分布上存在显著差异。


  图2 2022年11月14日以后北京市BA.5.2和BF.7种群动态变化[1]

  BA.5.2和BF.7在北京地区的有效种群规模都发生了扩张,表明这两个系的遗传多样性有所增加(图4A,B),但BA.5.2和BF.7的扩张模式不同。BA.5.2的有效种群规模在11月14日至11月25日之间变化不大,但在11月30日左右急剧增加,而BF.7的有效种群规模从11月14日开始逐渐增加。北京市BA.5.2有效种群规模的突然扩大与11月30日前后BA.5.2感染数量的增加是一致的(图4C)。

  同一时期,国际上流行的新冠病毒变异株(包括XBB和BQ.1)未在北京本地感染病例中检测到。文章表示虽然研究数据仅来自北京,但由于频繁的人口交流和高传播性的流行毒株的存在,该结果可以被认为是中国的一个缩影。

  参考文献:

  [1] Pan Y, Wang L, Feng Z, et al. Characterisation of SARS-CoV-2 variants in Beijing during 2022: an epidemiological and phylogenetic analysis[J]. The Lancet, 2023. S0140-6736(23)00129-0.

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