双噬菌体扩培介导的多重检测策略同时检测肠沙门氏菌和金黄色葡萄球菌

2023-04-18 00:00:00
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核心提示:本文将双噬菌体扩培策略(PAA)的高灵敏度和多重检测技术的特异性相结合,探索了一种新方法,该方法能够快速、特异、灵敏地同时定量检测常见食源性病原体——沙门氏菌和金黄色葡萄球菌。

  多重细菌检测对于监测关注多种病原体的各种病原体情况至关重要。本文将双噬菌体扩培策略(PAA)的高灵敏度和多重检测技术的特异性相结合,探索了一种新方法,该方法能够快速、特异、灵敏地同时定量检测常见食源性病原体——沙门氏菌和金黄色葡萄球菌。实验验证了单次和多次反应的分析灵敏度、特异性和稳定性,结果显示该方法对所有细菌的检出限均为10 CFU/mL,成功应用于实际食品样品中,可将检测时间缩短4 h以下,为同时检测活菌提供了一种有效且有前景的方法。

  一、实验流程

  以两种新型沙门氏菌噬菌体SEP37和葡萄球菌噬菌体LSA2311为基础,对PAA进行开发。通过检测噬菌体靶基因,保证了高特异性。然后采用PAA-based qPCR分别对沙门氏菌和葡萄球菌进行单病原体检测,将PAA与多重qPCR结合,同时检测这两种菌。

  图1 PAA—多重qPCR用于同时和多重检测食源性致病菌原理图

  二、实验结果

  1、杀病毒剂的选择

  PAA的一个关键组成部分是选择有效的杀病毒剂,实验评估了硫酸亚铁、FAS和七水硫酸镁(MAS)的杀病毒活性。结果表明,如图2所示,MAS组和对照组之间没有差异,FAS和硫酸亚铁组的噬菌体滴度显著降低,FAS有更好的稳定性。用浓度为30mM的FAS处理后,噬菌体在该浓度下可以完全失活。将FAS处理组与对照组比较,细菌生长没有显着差异。因此,FAS可被选为杀病毒剂。

  图2 噬菌体-SEP37介导的PAA的优化

  2、通过PAA-qPCR定量检测沙门氏菌

  PAA-qPCR测定使用引物和TaqMan探针来靶向位于沙门氏菌噬菌体SEP37上的尾部基因。制备一系列10倍稀释的噬菌体SEP37 DNA以计算扩培效率并生成标准曲线,扩增效率为104%。循环阈值(Ct)值>1时,样品被认为是沙门氏菌阳性。检测限(LOD)被定义为产生Ct值信号变化的最低细菌浓度。如图3所示PAA-qPCR检测能够检测LOD为10 CFU/mL的沙门氏菌。对5种主要食源性病原体进行检测,沙门氏菌和沙门氏菌的混合物组的Ct值明显低于其他组的Ct值,表明该测定可以特异性检测LOD为10 CFU/mL的活沙门氏菌。

  图3 PAA-qPCR定量检测沙门氏菌

  3、PAA-qPCR定量检测金黄色葡萄球菌

  基于葡萄球菌噬菌体LSA2311的末端酶基因的大亚基设计了一组引物和Taqman探针。制备一系列10倍稀释的噬菌体LSA2311 DNA以计算扩培效率并生成标准曲线。PAA-qPCR结果如图4,Ct值在1-10之间呈线性,扩增效率为108%,LOD 为 10 CFU/mL。PAA-qPCR测定可以特异性检测活的金黄色葡萄球菌ATCC25923及其混合物。

  图4 PAA-qPCR定量检测金黄色葡萄球菌

  4、PAA介导的多重qPCR检测

  以不同靶标噬菌体DNA拷贝数的对数作为横坐标,评估多重qPCR扩增效率。如图5所示,PAA介导的多重qPCR测定与PAA介导的沙门氏菌或葡萄球菌qPCR测定的扩增效率之间没有显着差异。制备不同浓度的沙门氏菌和金黄色葡萄球样品,使用标准曲线推导样品浓度,结果表明两种菌的检出限低至10 CFU/mL,且该测定具有高度特异性。

  图5 PAA-多重qPCR的敏感性、特异性和稳定性

  5、食物样品评估PAA-多重qPCR检测方法

  采用基于PAA-多重qPCR方法对牛奶、生菜里的沙门氏菌和金黄色葡萄球菌进行定量。不同浓度的沙门氏菌和葡萄球菌被到样品中。如图6所示,牛奶、生菜样品中两种细菌的检测限均为 10 CFU/mL。

  图6 牛奶、生菜样品评估PAA-多重qPCR检测方法

  三、实验结论

  研究人员提出了一种基于噬菌体扩培(PAA)和多重qPCR同时检测肠道沙门氏菌和金黄色葡萄球菌的策略,具有高度特异性和准确性,该方法可使检测限可在4 h内降低至10 CFU/mL,成功地在真实食物样品(牛奶、生菜)上进行了验证,所得结果与传统平板计数相当。该方法快速、简便、成本低,可用于现场筛查,防止各种食品中食源性病原体的污染。

  参考文献:Huang Chenxi,Zheng Ranjing,Ding Yifeng,R. Nugen Sam,Wang Xiaohong. Dual phage amplification-mediated multiplex detection strategies for the simultaneous detection of Salmonella enterica and Staphylococcus aureus[J]. Talanta,2023,253.

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