耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)是医院获得性感染的主要原因，由于对目前所有抗生素类别的耐药性正在出现，医院获得性感染正变得越来越难以对抗。人们对MRSA的进化起源知之甚少，没有合理的命名法，对于主要MRSA克隆的数量或来自不同国家的克隆的亲缘关系也没有共识。

  本文解决了所有这些问题，并提供了比以前更彻底和更精确的MRSA克隆进化分析。利用多位点序列分型和BURST算法，分析了国际上912株MRSA和甲氧西林不敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)分离株。在5组相关基因型中鉴定出11个主要的MRSA克隆。利用BURST推断出每一组的假定祖先基因型和每个祖先分离株的最简约的下降模式，并结合对甲氧西林耐药基因的分析，确定了每个主要MRSA克隆的可能进化起源，原始MRSA克隆及其MSSA祖先的基因型，以及甲氧西林耐药基因的获得和水平移动的程度。主要的MRSA克隆从成功的流行MSSA菌株中反复出现，而对万古霉素(最后一种抗生素)敏感性降低的分离物是从其中一些主要MRSA克隆中产生的，突出了在少数生态成功的金黄色葡萄球菌基因型中耐药性增加的令人沮丧的进展。

  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC124322/pdf/pq1102007687.pdf?origin=publication_detail