挖掘新型抗菌肽有哪几种方法?

2023-03-08 00:00:00
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核心提示:抗菌肽代表了一类有前途的新型抗生素。细菌素通常被认为是由G+和G−细菌合成的小分子核糖体多肽或蛋白质,可以抑制或杀死其他相关或无关的微生物。

  面对抗生素发现的减少,多重抗生素耐药性增加是社会最紧迫的健康问题之一。抗菌肽代表了一类有前途的新型抗生素。细菌素通常被认为是由G+和G−细菌合成的小分子核糖体多肽或蛋白质,可以抑制或杀死其他相关或无关的微生物。

  一、 传统分离提纯

  分离纯化是获得细菌素的有效方法之一。通过XAD-2、阳离子交换层析、凝胶层析和反相高效液相等一系列纯化步骤,鉴定了植物乳杆菌ZJ008分泌的车前素ZJ008,并显示出对革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌的广谱抗菌活性。

  二、 生物信息学方法

  细菌素是由核糖体合成的多肽,因此可以通过基因挖掘工具揭示新的细菌素基因簇。值得注意的是,基因组工具,如BAGEL3和抗SMASH,结合特定的BLAST搜索和BACTIBASE,使新化合物的鉴定变得容易得多。

  三、 异源表达

  在野生菌株中,细菌素的产量通常很低。为了提高细菌素的产量,许多研究人员对生产异源表达细菌素的重组蛋白进行了研究。细菌素的生产一般有四种异源表达策略:大肠杆菌、乳杆菌、酵母细胞和化学合成。

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