含核糖体β氨基酸的肽和蛋白质被微生物广泛利用

2023-05-30 00:00:00
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核心提示:苏黎世联邦理工大学和复旦大学的合作成果显示,含β氨基酸的微生物核糖体肽家族广泛存在(称为剪接肽),并且它们是高效的蛋白酶抑制剂。

  苏黎世联邦理工大学和复旦大学的合作成果显示,含β氨基酸的微生物核糖体肽家族广泛存在(称为剪接肽),并且它们是高效的蛋白酶抑制剂。

  以往的研究中β-氨基残基被认为是核糖体产物中极其罕见的特征:只在蓝藻的Nif11型核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPP)途径中发现β-氨基残基可以通过一个非典型的酶切过程被利用。但该途径的最终产物去向仍是未知。但近期基于生物信息学数据分析结果显示核糖体β-氨基酸产物在不同的细菌系以及古细菌中的分布之广出乎意料。对27个细菌剪接酶-底物对的特征分析证实这些 "剪接 "产物包括许多以前未被识别的RiPP类型以及蛋白质,包含35到>600个残基,并具有单个到多个α-酮-β-氨基酸基团。自由基剪接酶执行重要的翻译后修饰过程:将不同的β氨基酸(酮酰胺)结合到核糖体合成的肽和蛋白质中。这项发现突破了我们对于细菌的传统认知,即核糖体生物合成利用α-氨基酸。实验测试了三个不同的剪接基团,它们都表现出了异常强大的蛋白酶抑制活性。这项发现大大扩展了合成生物学中核糖体相关产品的范围,为未来的药物研发提供了极具潜力的新方向。

  参考来源:

  1. https://biol.ethz.ch/en/news-and-events/d-biol-news/2022/10/widespread-microbial-utilization-of-ribosomal-amino-acid-containing-peptides-and-proteins.html

  2. Scott, T. A., Verest, M., Farnung, J., Forneris, C. C., Robinson, S. L., Ji, X., Hubrich, F., Chepkirui, C., Richter, D. U., Huber, S., Rust, P., Streiff, A. B., Zhang, Q., Bode, J. W., & Piel, J. (2022). Widespread microbial utilization of ribosomal β-amino acid-containing peptides and proteins. Chem, 8(10), 2659-2677. http://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.chempr.2022.09.017

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