毒素-抗毒素系统广泛存在于细菌中。它们通常由两种成分组成：一种是抑制重要细胞过程的毒素，另一种是对抗其同源毒素的抗毒素。毒素-抗毒性系统的最小组成由一种毒素及其同源抗毒素组成，该毒素会毒害细胞。编码这两种成分的基因总是遗传连接的，通常被组织为操纵子(I型和VIII型系统除外)。抗毒素是在不同水平上抑制毒性的RNA或蛋白质：毒素的翻译、活性甚至稳定性。毒素-抗毒素系统的分类是基于抗毒素的性质和作用模式。按照发现的顺序编号，当前的类型如下(图1)：

  图 1 毒素抗毒素系统的分类

  I型抗毒素是使其同源毒素的转录物沉默的小RNA;

  II型抗毒素是与同源毒素结合并形成中和复合物的蛋白质;

  III型抗毒素是一种小的假结RNA，它与同源毒素结合，并通过形成中和蛋白-RNA复合物来隔离它们;

  IV型抗毒素是作用于其同源毒素的细胞靶点的蛋白质，可以保护或解毒靶点，而不是阻断毒素本身;

  V型核糖核酸酶抗毒素通过特异性降解其信使核糖核酸来防止毒素的积累;

  VI型抗毒素是作为衔接子的蛋白质，靶向其同源毒素，通过ATP依赖性蛋白酶进行降解;

  VII型抗毒素是通过翻译后修饰使同源毒素失活的蛋白质;

  VIII型抗毒素是通过作为反义RNA或通过模仿CRISPR RNA，该RNA募集作为转录抑制因子的Cas蛋白。

  II型毒素-抗毒素系统可能是最丰富和多样化的，在大多数细菌和一些古菌的基因组中都有代表性。I型、III型、IV型、VII型和VIII型的代表性较低，而V型和VI型仅由一个单一的代表性系统。