腹泻是全球儿童发病和死亡的主要原因，可引起严重脱水，并导致电解质紊乱，维生素缺乏和营养不良。因此，腹泻增加了危及生命的疾病风险，并对五岁以下儿童的身体和认知发育迟缓产生长期影响。轮状病毒已被全球公认为主要腹泻病原体，其中A型轮状病毒占人类感染的90%以上。

  肠道菌群是人体不可或缺的组成部分，主要由寄居在胃肠道的细菌、古菌、病毒和真核生物组成。肠道微生物群落相对稳定，但可能会因年龄、饮食、地理和营养状况等因素发生巨大变化，而癌症、肥胖、糖尿病和克罗恩病等疾病与肠道微生物群的生态失调有关。腹泻是一种主要的生态失调事件。目前，基于测序技术的研究主要集中在细菌组，而病毒组的变化仍然是一个谜，因此有必要研究腹泻后肠道病毒组的组成和丰度如何发生变化。

  2023年发表在Gut Microbes上的这篇文章，旨在探讨腹泻儿童和健康儿童之间肠道病毒组的差异。该研究于2018年收集上海地区76份腹泻粪便样本和27份健康人群粪便样本，以及泰州地区40份腹泻粪便样本和19份健康人群粪便样本，调查肠道病毒组的组成。

  病毒宏基因组分析显示，腹泻病毒组的alpha多样性与健康病毒组无显著差异，而beta多样性在腹泻儿童与健康儿童之间存在显著差异(图1)。为了揭示肠道病毒群落的不同组成，该研究在科水平和物种水平上鉴定了病毒序列。结果显示，在病毒科水平，共分为25个病毒科，包括17个DNA病毒科和8个RNA病毒科(图2)，在物种水平上，共鉴定出了575种病毒(图3)。腹泻病毒组主要以腺病毒科、星状病毒科、杯状病毒科和微小核糖核酸病毒科为主。同时，健康病毒组也含有噬菌体，包括微病毒科和尾病毒目。不同肠道病毒在所有样本中均有较高的流行率，在腹泻组中微病毒科和尾病毒目丰度较低。

  图1腹泻组和健康组之间病毒群落的比较

  图2肠道病毒群落在科水平的组成

  图3肠道病毒群落在物种水平上的组成

  该研究加深了对腹泻于人类肠道病毒群影响的认识，揭示了儿童中多种肠道病毒的广泛流行，为有效治疗和预防儿童腹泻等病毒感染性疾病提供参考。

  参考文献：

  [1] S. Bao, H. Wang, W. Li, H. Wu, C. Lu, L. Yong, et al., Viral metagenomics of the gut virome of diarrheal children with Rotavirus A infection, Gut Microbes, 15(2023) 2234653.

  链接：

  https://doi.org/10.1080/19490976.2023.2234653