一般的天然发酵都是寄生在蔬果植物上的酵母菌起的作用。酿酒、发面都依赖酵母菌。但是从对人体有益和有害的角度分析，酵母菌并不能完全属于益生菌。因为酵母菌是一个种类繁多的庞大家族，其性质和作用差距非常大。

  比如说布拉氏酵母菌可以应用于药物，用于治疗成人和儿童腹泻，及肠道菌群失调所引起的腹泻症状。然而白色念珠菌就是致病菌了，它可引起皮肤、口腔、黏膜和内脏的急、慢性感染。

  酵母菌喜欢阴暗潮湿的环境。人体的大肠、口腔、喉咙、女性阴道就是念珠菌经常栖息的场所。当我们的体内菌群平衡的时候，有害酵母菌的作用不显现。如果我们滥用抗生素、固醇类药、避孕药等，干扰了体内菌群的平衡，有害酵母菌就会显现出极大的破坏性。这种破坏性超出我们的想象。免疫、神经和内分泌系统都会被波及。

  与酵母菌相关的神经系统疾病有：忧郁症、头痛、记忆力减退、慢性疲劳。

  与酵母菌相关的内分泌系统疾病有：消化不良、月经不调、性功能障碍。

  至于泌尿感染、阴道炎、鹅口疮等是更常见的疾病。

  酵母菌导致疾病的根源在于肠道，轻易的服用抗生素是祸首。在其他方面，过度的吃甜食、生活中接触的化学品(比如洗涤剂、消毒液)也会对酵母菌的恶劣影响产生促进作用。医学上找不出明确原因的疼痛和不舒服感，有可能和酵母菌有关。使用抗菌类药物或者益生菌，把焦点放在肠道方向，才是治本之道。