我们的肠道里藏着各种各样的微生物，包括有益菌和有害菌，这些菌群微生物与人体健康息息相关，对人体营养物质代谢、人体自身发育、免疫及疾病的产生等方面都起到极其重要的作用。现有的研究表明，健康人的肠道细菌与某些疾病患者显著不同，肠道微生物与多种疾病发病直接相关，比如癌症、心血管疾病、神经性疾病等。

  另外，肠道菌群的组成进一步也收到多种因素的影响，如饮食、地理、运动水平、抗生素和其他药物的影响等，不良因素会对肠道微生物产生有害的影响，进而导致相关疾病患病率的上升。

  肠道菌群与大脑之间的相互作用也一直是研究的热点，现有的研究表明，肠道微生物能通过神经、免疫和内分泌途径与中枢神经系统沟通交流，从而影响大脑功能，进而影响个体的情绪和行为，该过程被称为肠-脑轴。无菌动物模型、病原体感染、益生菌干预或抗生素处理的动物研究表明，肠道菌群在调节焦虑、情绪、认知和疼痛方面发挥重要作用。因此，调节肠道菌群已经成为预防和治疗错综复杂的中枢神经系统疾病的新兴策略。

  肠道和大脑之间的双向交流影响健康和疾病，微生物群有助于大脑发育和功能以及行为。肠道微生物群有助于小鼠的社会活动，但调节这种复杂行为及其潜在神经基础的肠道-大脑连接尚不清楚。研究表明，特定的肠道细菌可以抑制 HPA 轴的激活，并表明微生物群可以通过介导大脑应激反应的离散神经回路影响社会行为。