核心提示：在人体的肠道中，他们发现了约14万种病毒，更重要的是，从未被发现的病毒种类竟达到了50%。该数据库代表了迄今为止最全面，最完整的人类肠道噬菌体基因组库，并得到了其它已发表的肠道噬菌体数据库的补充。
大约在30多亿年前，包括病毒、细菌和真菌的微生物就已经出现了。人体内也被数以亿计的微生物占据，形成人体和共生菌群的多元复合体。而存在在人体肠道的微生物，是肠道疾病发生的罪魁祸首，也是人类过敏、肥胖等疾病等的重要原因之一。
2021年2月，英国科学家Luis F. Camarillo-Guerrero等在《Cell》杂志上发表了题为：Massive expansion of human gut bacteriophage diversity的研究论文。
他们通过挖掘28,060个全球分布的人类肠道宏基因组和2,898个培养的人类肠道细菌参考基因组，建立了一个含有142,809种噬菌体的肠道噬菌体数据库(GPD)。也就是说，在人体的肠道中，他们发现了约14万种病毒，更重要的是，从未被发现的病毒种类竟达到了50%。该数据库代表了迄今为止最全面，最完整的人类肠道噬菌体基因组库，并得到了其它已发表的肠道噬菌体数据库的补充。
噬菌体(bacteriophage, phage)是感染细菌、真菌、藻类 、放线菌或螺旋体等微生物的病毒的总称，因部分能引起宿主菌的裂解，故称为噬菌体。肠道噬菌体可以定义为栖息在肠道中的噬菌体的聚集体。
利用GPD数据库对人类肠道噬菌体的宿主范围进行了最全面的分析。尽管大多数病毒被发现局限感染单一细菌种，但有相当大的比例(~
36%)被预测会感染多个物种、属、科、目甚至纲。宿主范围宽的噬菌体的一个后果是由于转导而增加了水平基因转移事件的连通性，这可能导致人类肠道中不同系统发育细菌物种之间的基因流网络的创建。
GPD的使用能够深入了解肠道噬菌体的流行病学。值得注意的是，利用噬菌体组成的全球变异来了解人类肠道噬菌体与个体和人群的生活方式有关。他们发现，在城市样本中发现的噬菌体靶向拟杆菌科细菌，而来自秘鲁，坦桑尼亚，马达加斯加和斐济的农村样本中含有的噬菌体，其宿主范围针对普雷沃氏菌科而不是拟杆菌。
在这项工作中，他们还展示了如何利用GPD来描述来自肠道的其他重要病毒亚家族。特别地，他们发现肠道噬菌体实际上由2个属组成，并且能够感染来自拟杆菌科和卟啉单胞菌科的细菌。在北美、大洋洲和亚洲，2种肠道噬菌体属的综合流行率达到了10%-15%的样本比例，而在欧洲，它被发现感染的细菌占样本的约37%。这些结果强调了建立定义明确的病毒肠道亚家族的重要性，因为高度相关的噬菌体基因组的组合效应大小可以帮助发现特定分支与其细菌宿主和人类健康的关联。
因此，拥有高质量噬菌体基因组的综合数据库，可以大大提高对人类肠道病毒组进行大量分析的速度，更容易理解肠道微生物组与不同生活方式、年龄以及最终健康和疾病的关系。
