细菌抗噬菌体Menshe系统由三类蛋白组成并具有高度结构域多样性,展现出广泛的功能适应性与进化潜力。
细菌与噬菌体的“战争”已经持续了数十亿年。为了抵御噬菌体的入侵,细菌进化出了多种防御系统。除了人们熟知的CRISPR-Cas系统,科研人员近年来陆续发现了超过100种新的抗噬菌体系统。最新的一项研究系统性解析了一种名为“Menshen(门神)”的抗噬菌体系统,揭示了其高度多样化和模块化的结构特点。
Menshen系统由三个蛋白组成:NsnA、NsnB 和 NsnC。NsnA 是负责识别病毒入侵的“感应器”,其核心结构是名为 DUF262 的保守结构域,能结合病毒DNA上的特定修饰。它的C端还带有一个DNA结合结构域,具备识别并稳定结合靶标DNA的能力。NsnB 是一类ATP酶,属于ABC-ATPase超家族。它可能在系统中承担信号转导或激活下游反应的角色,不过目前具体功能尚不明确。
NsnC 是效应蛋白,通常包含一个“非活性PIN-like”结构域用于靶标识别,以及一个具备毒性作用的核酸酶结构域,能降解噬菌体的遗传物质,起到清除作用。
研究人员通过比对上千个细菌基因组,发现Menshen系统具有高度的结构域多态性。这意味着不同细菌中的Menshen系统在结构上各不相同,但功能保持一致。尤其是NsnA蛋白,不同细菌中的N端可能携带多达30余种不同的感应结构域,大多数与DNA结合有关。这使得Menshen系统可以识别多种不同修饰的病毒DNA,提高防御的适应性。
NsnC蛋白的C端也同样多样,研究识别出至少15种毒性结构域,包括核酸酶、磷脂酶和拓扑异构酶等,具备切割病毒RNA或DNA的能力。这些结构域与其他细菌毒素蛋白和毒-抗毒系统中发现的酶活性相似,支持其在抗噬菌体反应中的执行功能。
Menshen一词来源于中国传统文化中的“门神”,象征守卫门户、防止邪祟入侵。这与系统的功能——防御外来噬菌体入侵——高度契合。近年来,多个新发现的细菌抗病毒系统都以神话角色命名,如Thoeris、Gabija、Shedu等,Menshen是其中首个以中国神祇命名的系统。
本研究不仅解析了Menshen系统的结构组成和功能分化,还建立了一个包含近2000种Menshen变体的基因数据库。通过蛋白结构预测、系统发育分析和序列聚类,研究揭示了该系统具有显著的可塑性和适应性,是细菌在长期演化过程中发展出的重要防线。
参考来源:
Li H, Tan Y, Basu D, Corbett KD, Zhang D. Unveiling the multifaceted domain polymorphism of the Menshen antiphage system. Nucleic Acids Res. 2025 May 10;53(9):gkaf357. doi: 10.1093/nar/gkaf357.
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