研究背景：

古细菌与真细菌（Bacteria）、真核生物（Eukarya）并列，构成生命的三大域。研究其基因组和代谢途径能帮助重建生命早期演化树。古细菌有着非凡的意义，例如：某些古细菌的代谢方式可能代表了最早地球生命的代谢方式，为研究生命起源和演化提供线索；对古细菌的研究能帮助人类窥视生命极限的机制（如超嗜热古菌、嗜盐古菌等），这些研究也为生物技术提供助力（如PCR技术中的耐高温核酸聚合酶等）；研究古细菌在生态与气候、生物技术与医学、天体生物学等方面都有着极为重要的意义。古细菌的研究也对传统的生命认知产生了挑战，如非典型细胞结构的揭示（古菌细胞膜的醚酯结构与基因组稳定性机制等）以及古病毒（柠檬状病毒）和防御系统（CRISPR系统）。对于古细菌的研究在生命科学的发展中有着不可或缺的作用。

日本研究的发现：

日本科学家发现"少彦古菌"——一种仅含189个基因的神秘微生物，其95%基因专攻DNA复制，几乎完全依赖宿主生存，模糊了生命与病毒的界限，为研究生命退化提供了独特样本。

这种新发现的的古菌被命名为“Candidatus Sukunaarchaeum mirabile”，其基因组仅 238 kbp，是目前已知最小的古菌基因组（比此前最小的古菌基因组小50%）。

系统发育分析表明，Sukunaarchaeum 代表一个全新的深层分支，独立于所有已知古菌门（如 DPANN、TACK、Asgard 等），可能需设立新的高级分类单元（如新门）。

Sukunaarchaeum基因组几乎完全缺失代谢途径（如能量产生、氨基酸合成），但完整保留了 DNA复制、转录、翻译 的核心基因（占编码基因的52.4%）。这种极端的基因丢失表明其高度依赖宿主（可能是甲藻）提供代谢支持，生活方式接近专性寄生或共生，挑战了细胞生命的最小功能定义。

尽管基因组极小，却编码多个 超大型膜蛋白（最长4756个氨基酸），可能参与宿主互作（如粘附或营养摄取）。蛋白质序列高度分化，分支长度是其他古菌的2.8倍，暗示加速进化可能与寄生适应相关。通过 Tara Oceans 数据库分析，发现 Sukunaarchaeum 的近缘类群广泛分布于海洋 5–20 μm 粒径组分（与单细胞真核生物大小匹配），支持其与宿主共生的假说。其原始宿主为甲藻 Citharistes regius，但环境数据表明其他 Dinophysales 甲藻或真核微生物也可能是相关类群的宿主。

研究意义：

Sukunaarchaeum 的极端简化模糊了细胞生命与病毒的界限——虽保留细胞结构（如核糖体），但代谢依赖性与病毒类似。揭示了古菌中未被探索的多样性，提示共生系统中可能隐藏更多类似奇特生命形式。

参考来源：

1.HARADA R, NISHIMURA Y, NOMURA M, et al. A cellular entity retaining only its replicative core: Hidden archaeal lineage with an ultra-reduced genome [J]. bioRxiv, 2025: 2025.05.02.651781.

2.https://astrobiology.com/2025/05/candidatus-sukunaarchaeum-mirabile-is-a-novel-archaeon-with-an-unprecedentedly-small-genome.html#:~:text=Here%2C%20we%20report%20the%20discovery%20of%20Candidatus%20Sukunaarchaeum,known%20archaeal%20genome%E2%80%94%20from%20a%20dinoflagellate-associated%20microbial%20community.

3. https://www.ithome.com/0/861/986.htm