非洲首次发现多重耐药沙门氏菌ST34动物源株：新型噬菌体与重金属抗性岛揭示全球传播风险！

图1. AmTI前噬菌体与沙门氏菌Typhimurium CP094337前噬菌体的比较。

ST34单相变异株首次现身非洲动物源：全球大流行克隆的“非洲足迹”

沙门氏菌Typhimurium单相变异株ST34（1,4,[5],12:i:-）自20世纪90年代在欧洲出现后迅速扩散至全球，成为欧盟第三大人类沙门氏菌感染元凶。此次南非研究首次从猪源中分离出该变异株，标志着其已在非洲动物链中“扎根”。全基因组测序显示，这些ST34株携带典型的ASSuT耐药谱（耐氨苄西林、链霉素、磺胺甲噁唑、四环素），并携带ESBL基因blaTEM-1B，提示其具备多重耐药能力。

新型噬菌体AmTI现身：sopE基因水平转移或助推毒力升级

研究团队在ST34株中发现一种新型sopE噬菌体，命名为AmTI（African monophasic Typhimurium I），与一株中国临床株中的噬菌体高度相似（>90%一致性）。sopE作为III型分泌系统效应蛋白，可增强细菌在宿主肠道中的侵袭与定植能力。该噬菌体的出现可能通过水平基因转移推动ST34株的毒力与适应性升级，为其在动物与人类之间的传播提供“分子通行证”。

SGI-4重金属抗性岛：畜禽养殖环境中的“隐形助推器”

所有ST34株均携带SGI-4（Salmonella Genomic Island 4），该岛编码铜、锌等重金属抗性基因，首次在非洲动物源株中发现。SGI-4被认为有助于细菌在富含重金属的养殖环境中生存，并可能通过促进细菌在肠道中的定植与持留，增强其传播潜力。研究人员指出，SGI-4的存在可能是ST34株在全球畜禽链中持续扩散的重要“环境适应因子”。

动物-人类传播链条浮现：SNP差异仅4–10个，提示本地传播事件

系统发育分析显示，南非猪源ST34株与本地人类临床株之间仅相差4–10个核心基因组SNP，表明其可能属于同一传播链条。这些株还与2018年英国一株人类源ST34株共享较近祖先，提示该克隆可能通过国际贸易或人类流动进入南非。研究人员警告，尽管本研究中的猪只未直接进口，但南非80%的猪肉产品来自欧盟，ST34株或通过饲料、运输、人类携带等“隐形路径”完成跨洲传播。

关键发现

1、ST34单相变异株首次从非洲动物源（猪）中分离，填补全球监测空白。

2、所有ST34株携带SGI-4，赋予铜锌抗性，助力在养殖环境中持续存活。

3、猪源株与南非人类株仅4–10个SNP差异，系统发育上同簇，提示本地动物→人传播事件。

未来展望与应用潜力

研究团队建议，未来应结合基因组学、流行病学与贸易数据，构建ST34株的全球传播模型，识别高风险输入路径与本地传播热点。同时，应推动噬菌体疗法与疫苗研发，针对ST34株的特异性噬菌体（如AmTI）与毒力因子开展靶向干预。此次非洲动物源ST34株的发现，不仅填补了全球监测空白，也为“同一健康”框架下的耐药菌防控提供了关键证据。

参考来源：Ogundare S.T. et al. Identification of multidrug-resistant monophasic Salmonella Typhimurium ST34 and other NTS from animal–environmental origins in South Africa. npj Antimicrobials & Resistance, 2025, 3:89. 10.1038/s44259-025-00159-3.