华大构建鼻腔微生物组,揭秘人体呼吸道健康隐形“防线”
华大构建鼻腔微生物组,揭秘人体呼吸道健康隐形“防线”
呼吸系统疾病在全球范围内造成了巨大的健康负担,影响了数10亿人的生活。流行病学研究表明,男性和女性在呼吸道感染(RTI)的发病率和严重程度方面存在巨大差异。呼吸道是我们与外部空气环境接触的重要屏障,鼻腔是呼吸道屏障的第一道“防线”。鼻腔微生物组研究迄今仅限于小样本量或基于基因的保守测序(16S rRNA、18S rRNA、ITS),鼻腔微生物组的性别差异从未被系统评估。
2024年10月8日,华大生命科学研究院在Genome Biology在线发表题为“Integrated large-scale metagenome assembly and multi-kingdom network analyses identify sex differences in the human nasal microbiome”的研究性文章。该研究基于华大自主测序平台,开展大规模的宏基因组高通量深度测序,构建了迄今为止最为全面的鼻腔微生物群落目录,首次系统评估了鼻腔微生物这些“防线”的强度,为开发新的预防和治疗策略提供了重要线索。
作者从1593名健康年轻成年人的鼻腔样本中成功测序出4197个不同的细菌基因组,包括82个新发现的物种。作者进一步结合鉴定的131种真菌,为研究人类鼻腔微生物群落提供了宝贵资源。在分类学和功能水平上系统评估了性别差异,发现年轻成年男性和女性的鼻腔微生物组具有独特的结构。网络分析是推断微生物区诺关键分类群的有力工具,作者利用网络分析捕捉到女性鼻腔微生物组的生态稳定性和拮抗潜力明显高于男性。通过网络分析确定的关键细菌显示,性别依赖的进化特征可能对这些差异有所贡献,表明遗传进化力量在塑造鼻腔微生物群落的性别特异性方面发挥了作用。
该研究应用深度鸟枪法宏基因组测序、从头组装和网络分析,构建了迄今为止最全面的人类鼻腔微生物组。基于此,作者构建了一个非冗余的鼻腔细菌MAGs目录,揭示了健康年轻人鼻腔微生物组的广泛性别差异。这些结果为观察到的男性和女性在呼吸道疾病中饿差异提供了有价值的见解。
参考文献:Yanmei, Zhe, Mingliang, et al. Integrated large-scale metagenome assembly and multi-kingdom network analyses identify sex differences in the human nasal microbiome [J]. Genome Biology. (2024)25:257.doi: 10.1186/s13059-024-03389-2
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