在月经周期期间，阴道微生物的组成是动态变化的，但是目前仍不清楚这些差异是固有的微生物群差异还是由宿主驱动的差异。近日，在Microbiome上的发表文章Defining Vaginal Community Dynamics: daily microbiome transitions, the role of menstruation, bacteriophages, and bacterial genes围绕这一问题进行探讨。

为了研究这一问题，研究人员通过采集健康女性整个月经周期的阴道拭子进行宏基因组测序，评估阴道微生物群的动态变化以及微生物之间的互作，揭示阴道微生物群快速而周期性的变化。

图1 文章标题

首先，基于月经周期中阴道微生物社区群落类型的变化，研究人员将阴道微生物分为四种阴道群落社区动态，并开发了一个分类工具VALODY。根据月经周期中阴道菌群社区类型的变化，将其分为四种阴道群落社区动态，分别是：恒定的生态型、恒定的失调型、与月经相关的和不稳定的失调型。随后，研究人员探究了宿主行为及物种、菌株、基因和噬菌体水平的微生物差异对阴道动态变化的影响，发现即使在相同的阴道微生物社区群落类型下，不同阴道群落社区动态的女性在相对噬菌体丰度和细菌组成上存在显著差异。同时，不稳定群落社区动态的妇女有更高的噬菌体计数，含有的加德纳菌株更可能含有细菌素编码基因，并且更可能由惰性乳杆菌主导。

图2 噬菌体的相对丰度与CST和阴道群落动态有关

已有的阴道微生物社区菌落类型将女性阴道微生物菌群根据主导阴道菌群大致分为5个群落类型，阴道群落社区动态在此基础上提供了新颖的时间序列分类方法，强调了不同程度阴道菌群失调的复杂性。该研究还表明噬菌体基因丰度和存在的基因组菌株在永久性阴道微生物群落失调的启动和维持中发挥重要作用。表征了阴道微生物群动态变化的不同类型，提供了对阴道微生物群复杂性的深入了解，有助于女性阴道等疾病的研究。

参考资料：Hugerth, L.W., Krog, M.C., Vomstein, K. et al. Defining Vaginal Community Dynamics: daily microbiome transitions, the role of menstruation, bacteriophages, and bacterial genes. Microbiome 12, 153 (2024). doi: https://doi.org/10.1186/s40168-024-01870-5.