金黄色葡萄球菌是一种人类病原体，可引起从皮肤感染到感染性休克的严重疾病。噬菌体既是金黄色葡萄球菌的自然杀手，提供了治疗的可能性，也是该物种水平基因转移(HGT)的重要载体。在这里，作者使用高通量方法来了解菌株对噬菌体敏感性变化的遗传基础，这定义了宿主范围。研究筛选了259株不同的金黄色葡萄球菌菌株，涵盖40多个序列类型，对8种噬菌体敏感，这些噬菌体是感染该物种的3个噬菌体类的代表。噬菌体在宿主范围内变化，每个噬菌体感染73 ~ 257株。使用全基因组关联方法，确定了影响宿主范围的假定位点，并使用USA300转座子敲除验证了它们的功能。除了重新发现已知的宿主范围决定因素外，还发现了几个以前未报道的影响噬菌体感染期间细菌生长的基因，包括trpA, phoR, isdB, sodM, fmtC, 和 relA。作者使用来自宿主范围矩阵的数据来开发预测模型，准确率在40%到95%之间。这项工作说明了金黄色葡萄球菌噬菌体易感性的遗传基础的复杂性，但也表明，如果有更多的数据，可能能够了解大部分的变异。有了宿主范围确定的知识，可以合理地设计噬菌体治疗鸡尾酒，针对最广泛的金黄色葡萄球菌宿主菌株，并解决有关噬菌体-宿主相互作用的基本问题，如噬菌体对金黄色葡萄球菌进化的影响。

  本研究的重要意义在于，金黄色葡萄球菌这种广泛存在的医院和社区获得性病原体，其中许多菌株对抗生素具有耐药性。它会引起多种疾病，从局部感染到全身感染，并影响皮肤和许多内部器官，包括心脏、肺、骨骼和大脑。它的普遍性、抗生素耐药性和疾病负担使得新的治疗方法迫在眉睫。抗生素的另一种替代疗法是噬菌体疗法，是利用感染细菌的特异性病毒清除细菌的方法。在这项工作中，作者通过测试代表噬菌体宿主范围的金黄色葡萄球菌物种多样性的菌株，并将菌株的基因组序列与宿主范围联系起来，鉴定并验证了影响噬菌体宿主范围(噬菌体可以感染和杀死的菌株数量)的金黄色葡萄球菌基因。这些发现提高了对噬菌体疗法如何在细菌中起作用的理解，并根据感染菌株的预测宿主范围提高了噬菌体疗法疗效的预测。

  参考文献：https://doi.org/10.1128/mSphere.01263-20.