羊毛硫肽基因簇的基因组挖掘与重建

　　人类微生物群中的细菌产生有抗菌作用的核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)，以杀灭包括病原菌的竞争对手。在肠道中，产生RiPPs的细菌可以防止致病性大肠杆菌科细菌和万古霉素耐药肠球菌生长。在皮肤上，可杀死传染性金黄色葡萄球菌。同时，它们也是许多益生菌的活性成分，可以用于处理食物。生物信息学研究结果表明，从人类微生物组中发现抗菌药物的潜力是巨大的。

　　在本研究中，作者扫描了2229个人类微生物组项目基因组以寻找编码RiPP的基因簇，这些基因组信息来自皮肤、胃肠道、泌尿生殖道、口腔和气管等不同部位。最终发现了218种羊毛硫肽和25种套索肽，其中70种在大肠杆菌中合成并表达，23种可以纯化并进行功能表征。测试了它们对与健康人类菌群和病原体相关的细菌的活性，发现了针对与皮肤、鼻腔和阴道菌群失调有关的菌株以及选择性针对肠道菌株的口服菌株的新抗生素。针对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌和耐万古霉素肠球菌发现了有效的广谱和窄谱肽类抗生素。

　　应用基因组挖掘技术从人类微生物群中鉴定、生产和筛选肽类抗生素，挖掘与人类相关的微生物产生的天然产物，将有助于阐明生态关系，并可能成为发现抗菌药物的丰富资源。

　　羊毛硫肽基因簇的基因组挖掘与重建