新西兰海鲜、园艺和工厂环境中分 离出基因组多样性的单核细胞增生李斯特菌
细胞增生李斯特菌是一种重要的兼性细胞内病原体,在过去几十年中被认为是严重食源性疾病暴发的病原体。单核细胞增生李斯特菌是非孢子菌、棒状兼性厌氧菌,在自然界中无处不在。它已从一系列生态位和来源中分离出来,包括土壤、水、新鲜农产品、即食食品、粪便和腐烂材料。单核细胞增生李斯特菌本质上很健壮,能够在一系列恶劣的环境条件下生存。单核细胞增生李斯特菌可以在食品加工表面形成生物膜。这使得它能够随着时间的推移而持续存在,特别是对食品工业构成重大挑战人类李斯特菌病是由单核细胞增生李斯特菌引起的,这是由于食用受污染的生食或加工食品,包括牛奶和奶制品、肉类、蔬菜、海鲜和即食食品,据记录李斯特菌病的死亡率高达20-30%。

尽管单核细胞增生李斯特菌无处不在,但对新西兰李斯特菌病的来源知之甚少,因为许多病例是散发的,估计占 2018 年食源性李斯特菌病的 87.8%。食源性李斯特菌病的暴发归因于海鲜和园艺产品。这些是新西兰的重要产业,出口目标不断增长。先前的研究已经在新西兰食品加工环境和工厂中发现了持续的单核细胞增生李斯特菌菌株,然而,菌株很少从最终产品中分离出来。这些菌株在工厂中存在,但很少出现在产品上,这引发了人们对这些菌株对食品安全和公共卫生影响的质疑。此外,鉴于新西兰患有相当多的食源性疾病,食源性李斯特菌病已被通知为最严重的,谨慎地研究食品和各自食品加工环境中单核细胞增生李斯特菌的遗传特征。将这些菌株与新西兰以外的类似菌株进行比较,可以深入了解它们在全球的分布及其对食品安全和公共卫生的潜在影响。通过比较来自新西兰海产品和园艺来源的单核细胞增生李斯特菌分离株及其各自的加工或工厂环境与来自公开可用的国际分离株的遗传特征,以更好地了解其与国际分离株相比的分布、遗传多样性和种群结构。
用于表征从新西兰不同食品加工厂分离的单增。反过来,将表征分离株与国际单核细胞增生李斯特菌分离株进行比较,以更好地了解单核细胞增生李斯特菌菌株的种群结构和全球分布。尽管PFGE可以用作提供菌株之间相对区分的初始筛选具,但MLST提供了更大的系统发育推断和更少的模糊聚类,基于WGS的分型允许提高对PFGE的鉴别能力。与国际种群相比,新西兰分离株似乎是独一无二的,尽管有些聚集在全球分离株中,但大多数分离株在系统发育树上形成了不同的簇。目前的研究还发现,新西兰存在早在1950年代就被隔离的流行性克隆,这带来了重大的公共卫生问题。基因组比较还表明,尽管大多数新西兰分离株来自食品加工和包装环境,但一些分离株与国际人类疫情和临床分离株一起在基因上聚集,这表明必须同时研究人类临床分离株和食品加工厂单核细胞增生李斯特菌分离株,以建立工厂分离株与人类临床病例之间的联系。
参考文献
[1] Mohan, V., Cruz, C. D., van Vliet, A. H. M., Pitman, A. R., Visnovsky, S. B., Rivas, L., Gilpin, B., and Fletcher, G. C. (2021) Genomic diversity of Listeria monocytogenes isolates from seafood, horticulture and factory environments in New Zealand. International Journal of Food Microbiology 347.
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