人畜共患病毒将是未来大流行病的主要威胁

蝙蝠是目前最多样化的飞行哺乳动物，共有1400多种，约占所有现存哺乳动物种类的20%。且地球上大多数栖息地都有分布。迄今为止，已知的31个病毒科与蝙蝠有关。仅2018年至2022年期间，共鉴定出来自19个病毒科的72种新型病毒，特别是类双生病毒科和冠状病毒科。蝙蝠具有独特的免疫特性，可以保护自己免受病毒侵害并保持免疫力，这使它们能够成为潜在的病毒库。

蝙蝠相关大流行

由于蝙蝠与埃博拉病毒、尼帕病毒和冠状病毒引起的全球疫情有关，因此蝙蝠引起了公众的极大关注。果蝠是埃博拉病毒的宿主，并导致了非洲的多次埃博拉疫情；尼帕病毒同样通过果蝠传播，首次在1998年于马来西亚和新加坡爆发。此后，病毒在孟加拉国和印度等国也多次出现疫情。历时三年之久的新冠病毒疫情溯源调查结果中，蝙蝠冠状病毒RaTG13毒株被确定为导致全球COVID-19大流行的SARS-CoV-2的潜在来源。

蝙蝠病毒多样性

目前，公共数据库中蝙蝠病毒基因序列的分类分布显示，与DNA病毒（14%）相比，RNA病毒（86%）占据绝对优势，且蝙蝠中的人畜共患病毒比例明显高于其他哺乳动物类群，其中一半以上的蝙蝠病毒是人畜共患病毒（其中41.6%是RNA病毒，14.1%是DNA病毒）。研究还发现类双生病毒科是新发现的DNA病毒中最多的家族，该科的病毒包括一些新发现的病毒，其在不同宿主中的广泛存在，表明了蝙蝠病毒的多样性（图1）。RNA病毒中，大多数新发现病毒属于冠状病毒科。需要注意的是，尽管蝙蝠被视为某些冠状病毒的主要宿主，但并非所有蝙蝠种类都携带这些病毒，也并非所有蝙蝠中的冠状病毒都能感染人类或其他动物。

图1 2018年至2022年间发现新型病毒的蝙蝠物种的分类分布^[1]

NGS测序应用

过去十年NGS测序的广泛应用显著提高了病毒基因组测序的速度和通量，宏基因组学能够全面展示样本中存在的基因组多样性。这些方法可以直接从粪便、拭子、血液或组织等源样本中识别病毒，而无需在实验室中进行病毒培养（且一些病毒无法培养）。近年来，宏基因组学和测序平台的普及革命性地推动了病毒发现的研究，也导致从蝙蝠样本中新病毒识别的指数增长。

参考文献：

[1] Mo Y, Lim LS, Ng SK. A systematic review on current approaches in bat virus discovered between 2018 and 2022. J Virol Methods. 2024, 329:115005. doi: 10.1016/j.jviromet.2024.115005