用于生物标志物成像和肿瘤点诊断的光活化CRISPR/Cas12a传感器

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来源:王彦涛
2024-11-22 08:39:45
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核心提示:近年来,基于CRISPR/Cas12a的传感策略因其快速、敏感的特点而显示出特定目标检测的巨大潜力。然而,“总是活跃的”生物传感器往往不足以操纵具有高时空控制的核酸传感。开发核酸传感设备仍然至关重要,这些设备可以通过远程应用的刺激在所需的时间和空间上被激活。

近年来,基于CRISPR/Cas12a的传感策略因其快速、敏感的特点而显示出特定目标检测的巨大潜力。然而,“总是活跃的”生物传感器往往不足以操纵具有高时空控制的核酸传感。开发核酸传感设备仍然至关重要,这些设备可以通过远程应用的刺激在所需的时间和空间上被激活。本文将光激活与CRISPR/Cas12a系统集成,用于DNA和RNA检测,旨在为核酸传感提供高时空控制。

细胞范围内的光控CRISPR/Cas12a技术

尽管现有光控制CRISPR/Cas12a系统策略在避免脱靶反应和实现封闭、精确和高灵敏度核酸检测方面取得了一些突破。然而,尚未报道在细胞内生物成像和护理点(POC)检测领域开发光控CRISPR/Cas12a技术。

光控检测体系的实现途径

在CRISPR/Cas12a系统中,光控的实现涉及以下几个关键步骤:

1.光敏分子的引入:在CRISPR/Cas12a系统中引入光敏分子(如PCLinker),这些分子在特定波长的光照射下会发生光化学反应,如光解反应。

2.光解反应:当光敏分子受到特定波长的光(如365nm的紫外线)照射时,会发生光解反应,导致分子断裂,释放出原本被锁定的功能区域。

3.功能区域的释放与激活:光解反应后,原本被光敏分子锁定的功能区域(如crRNA)被释放,恢复其原有的结构和功能。例如,crRNA可以恢复其发夹结构,从而能够与Cas12a蛋白结合,形成活性复合物。

4.目标识别与信号输出:激活后的CRISPR/Cas12a系统能够识别特定的目标DNA序列,并启动非特异性的侧向切割活性,切割荧光报告分子(如FQ-Reporter或LFA-Reporter),从而产生可检测的荧光信号。

通过上述步骤,光控CRISPR/Cas12a系统可以在特定的时间和空间上精确调控其活性,避免非特异性反应,提高检测的准确性和灵敏度。这种光控策略不仅适用于体外检测,还可以扩展到活细胞内的生物成像和即时检测(POC)领域。

光控检测体系与试纸条技术相结合

试纸条(LateralFlowAssay,LFA)在本文中被用于与CRISPR/Cas12a系统结合,实现核酸切割信号的可视化,从而提供即时检测应用的潜力。具体作用如下:

1.核酸检测的可视化:试纸条与CRISPR/Cas12a系统结合后,可以用于检测HPV16等核酸分子。当样本中的目标核酸存在时,CRISPR/Cas12a系统会被激活,导致荧光信号的产生或特定标记物的切割。这些信号或标记物可以通过试纸条上的特定区域(如测试线和控制线)进行可视化,从而实现对目标核酸的快速检测。

2.即时检测应用:试纸条的设计使得检测过程简单、快速,并且可以通过肉眼直接观察结果。这种特性使得试纸条非常适合用于即时检测(Point-of-CareDiagnostics),即在患者身边或现场进行快速诊断。

3.提高检测的灵敏度和选择性:通过与CRISPR/Cas12a系统的结合,试纸条能够实现对目标核酸的高灵敏度和高选择性检测。论文中提到,这种方法的检测限(LOD)可以达到39pM,显示出其优异的检测性能。

4.用户友好和直观:试纸条的使用不需要复杂的仪器设备,检测结果可以通过肉眼直接关察,这使得检测系统更加用户友好和直观,适合在各种环境中使用。

关键发现

光激活机制:通过使用与crRNA互补的PC连接子(photocleavablelinker)来阻断CRISPR/Cas12a的切割活性,但在365nm紫外线照射下,PC连接子可以被光解,从而恢复CRISPR/Cas12a的活性。这种设计使得系统能够在需要时精确控制时间和空间上的激活。

多功能传感:该系统能够实现对不同类型生物分子的多重检测,包括HPV16和survivinmRNA的体外检测,检测限分别低至3.3pM和1.8pM。

活细胞成像:成功实现了在活细胞中对survivinmRNA的成像,显示了该方法在活细胞内靶标成像中的潜力。

即时检测应用:将测试条与CRISPR/Cas12a结合,实现了核酸切割信号的可视化,为即时检测应用提供了可能性。

研究前景

本文开发一种高效、灵敏且用户友好的生物传感系统,用于生物标志物的检测和即时诊断,特别是在活细胞成像和临床诊断中的应用。

参考来源:https://doi.org/10.1021/acs.analchem.3c05497


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