噬菌体诱导的染色体岛(PICI)作为捕获和检测细菌病原体的诊断平台
开发一个用户友好的诊断系统,基于PICI转导选择性富集细菌,允许大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的检测和顺序恢复。与传统的检测策略相比,该系统具有更高的转移速率和灵敏度,检测范围可达1050CFU·mL−1。传统的检测策略通常依赖于核酸分子检测,无法区分死的和活的生物体,与此相反,这种方法通过表达PICI中编码的报告基因,仅能视觉感知活的病原体。该方法将诊断传感机制扩展到无细胞合成生物学策略之外,从而实现新的合成生物学/生物传感工具包.
研究背景
传统的细菌检测方法依赖于资源密集型的膜过滤、管发酵和生化试验等,这些方法在低资源环境下难以实施。因此,开发快速、低成本的诊断方法变得尤为重要。PICIs作为一种移动的遗传元素,能够利用噬菌体组件促进其移动和传播,近年来被重新设计为抗菌无人机,为生物技术应用提供了新的工具。
研究结果
实验中,研究者们通过将PICIs携带的抗生素抗性标记引入到受体细菌中,测量了PICIs DNA在受体细胞中的转移和整合,从而实现了对细菌的检测。检测限(LOD)的实验结果显示,该系统能够检测到大约50 CFU mL−1的细菌,相较于噬菌体,具有更高的转移率和灵敏度。
结论
这项研究的创新之处在于利用PICIs作为诊断工具,提供了一种新的合成生物学/生物传感工具包。与传统的噬菌体检测策略相比,PICIs能够在不引起细菌裂解的情况下感染宿主,并且能够在不同的生长阶段与宿主共存,这使得PICIs成为一种理想的检测工具。此外,该研究还展示了如何将这种检测技术应用于纸基微流体设备中,为现场快速诊断提供了新的可能性。通过进一步的优化和实验,基于PICIs的诊断平台有望在未来的细菌检测和疾病预防中发挥重要作用。
创新点:活细菌的可视化检测
与传统的基于核酸的分子放大方法不同,这种基于PICI的平台能够直接作为信号转导器,仅识别活病原体。通过在纸微流体分析设备中开发检测格式,研究者们展示了该技术在低资源环境下的应用潜力,这对于食品安全和环境监测等领域具有重要意义。
关键发现:PICIs的诊断应用
(1)本研究的关键发现在于将PICIs转化为一种诊断平台,通过PICI转导来检测活细菌,避免了传统核酸分子检测方法无法区分死活细菌的问题。
(2)开发了一种基于PICI的纸微流体分析设备(μPADs),该设备不仅能够作为培养皿,还能够作为诊断传感器,实现了细菌的现场快速检测。
参考来源:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/advs.202301643
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