精准识别病毒的新利器:Cas13a“动态条码”实现多重RNA检测!

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来源:优在生物
2026-04-15 16:49:59
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核心提示:在病毒快速传播和变异频发的背景下,临床和公共卫生亟需一种快速、特异且可同时检测多种RNA目标的方法

在病毒快速传播和变异频发的背景下,临床和公共卫生亟需一种快速、特异且可同时检测多种RNA目标的方法。传统PCR虽然精准,但依赖复杂设备和耗时操作;而常规Cas13a检测虽可快速识别RNA,却难以实现多重病毒或变异株的同时检测。科学家们能否让单个Cas13a像“智能雷达”一样,同时锁定多个病毒目标?最新,美国加州大学伯克利分校的Daniel A. Fletcher团队在 《Nature Biomedical Engineering 》上发表了一项研究:通过“可编程动力学条码”(programmable kinetic barcoding),Cas13a可以利用自身酶学动力学的差异,实现无需分样、多重RNA同时检测。

一、灵感:让酶的“速度差”说话

研究团队发现,不同crRNA与目标RNA组合会让Cas13a的切割速度不同:有的快,有的慢,有的甚至呈现断断续续的信号增加。

团队巧妙地将这种速度差“条码化”,通过单个滴液中的Cas13a动力学曲线,就能识别不同RNA。

更妙的是,他们可以在crRNA上添加短DNA片段,精准调控Cas13a的酶活,从而生成独特的“动力学签名”,每种病毒或变异株都对应一个可识别的条码。

二、液滴实验:一个液滴,一种病毒

研究人员使用微小液滴,将每个液滴控制到平均只含有一个目标RNA分子。通过高速荧光成像,他们直接追踪单分子Cas13a的切割动态,发现:

单个Cas13a每秒可切割数百个报告分子,速度极快

不同crRNA/病毒组合显示出独特信号曲线(快速/慢速/波动模式)

多crRNA组合的滴液中,可同时读取多个RNA目标的动力学签名

这种方法就像给每种病毒贴上独一无二的“速度条码”,无需增加检测通道。

三、可编程条码:从概念到多重病毒检测

科学家们进一步验证了策略的通用性:

选取SARS-CoV-2不同变异株(野生型、Delta、Omicron)及流感H3N2和普通冠状病毒HCoV-NL63

通过在crRNA加上不同长度DNA片段,Cas13a动力学曲线呈现明显分离

同一个液滴中,四种病毒都能被精准区分,甚至量化各病毒在样品中的比例

更重要的是,他们在真实临床样本中测试,15份SARS-CoV-2阳性样本全部准确分类,可在1小时内完成检测。

四、机制:DNA片段调控酶活

模拟和实验显示,添加到crRNA 5′端的DNA片段靠近Cas13a活性位点,可暂时阻碍酶切活性。不同长度和序列的DNA片段生成不同切割速率,形成可预测、可编程的动力学签名。

换句话说,Cas13a不只是一个“剪刀”,还是一个可调速的“分子雷达”,通过速度识别病毒。

五、意义与前景

这项技术开辟了无需分样、多重RNA检测的新路径:

快速识别病毒及其变异株

可扩展到更多RNA目标,形成高度并行化检测

兼容现有数字液滴设备,无需复杂改造

总结:科学家让Cas13a从“单一剪刀”,进化为“速度条码识别雷达”,为精准、多重病毒检测提供了全新解决方案。

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