3D-DNA Walker检测克罗诺杆菌

江南大学的YangNingru等研究人员在通过截短策略优化原始适体序列后，开发了一种磁分离辅助DNAzyme驱动的3D DNA walker荧光适体传感器，用于检测食源性病原体克罗诺杆菌。用截短的适体探针和脱氧核酶链（AP-E1）的杂交体修饰的氧化铁磁性纳米颗粒（MNPs）表示为MNPs@AP-E1，被用作捕获探针。同时，使用DNAzyme驱动的3D-DNA助行器作为信号放大元件。基底链（Sub）与金纳米颗粒（AuNPs）缀合，导致形成AuNPs@Sub，用作3D步行道。在目标细菌和^Mg2+存在的情况下，E1脱氧核酶被激活并沿着AuNPs@Sub，连续释放信号探针。在优化的条件下，在¹⁰¹至^{106 CFU mL−1}的浓度范围内，观察到阪崎克罗诺杆菌（C.sakazakii）具有很强的线性相关性，检测下限为^{2 CFU mL–1}。不同克罗诺杆菌物种的荧光信号响应表现出不显著的差异，相对标准偏差为3.6%。此外，该适体传感器成功地完全应用于实际样品中阪崎肠杆菌的测定，回收率为92.86%-108.33%。因此，该新方法可以在无需复杂操作的情况下，成为超灵敏和选择性检测克罗诺杆菌的良好候选者。

参考文献：

Ningru Yang · Ning Ding · Shuo Qi · Zixuan Shang· Pengfei Ma · Imran Mahmood Khan · Zhouping Wang· Yu Xia1 · Yin Zhang · Lili Zhang. High‐affinity truncated aptamers for detection of Cronobacterspp with magnetic separation‐assisted DNAzyme‐driven 3D DNA walker. Microchimica Acta. 2024. 191: 130.

DOI: 10.1007/s00604-024-06199-2