对肠道噬菌体的新见解
对肠道噬菌体的新见解
肠道菌群在人体健康中起着重要作用。在过去的十年中,肠道微生物群的病毒部分(主要由感染细菌的噬菌体组成)受到越来越多的关注人体肠道中含有大量病毒,主要是噬菌体或噬菌体,它们会感染细菌。与其他病毒一样,噬菌体根据其核酸类型、衣壳形态(特别是是否存在尾巴)以及是否存在包膜进行分类。噬菌体的遗传物质由双链(ds)或单链(ss)DNA或RNA组成,其基因组大小范围从∼3.5 kb(例如,大肠杆菌噬菌体 MS2的ssRNA基因组)到∼540 kb(普雷沃氏菌LAK噬菌体的dsDNA基因组)。噬菌体之间存在相当大的多样性,但其中 95%是无包膜尾 dsDNA 噬菌体或 Caudovirales。在这个群体中,基于尾巴类型的传统分化为Siphoviridae,Myoviridae和Podoviridae家族,与系统发育并不完全一致,因此逐渐被放弃。
此外,新的噬菌体类型不断被发现,目前正在进行分类重组。在病毒宏基因组学发展的同时,还发现了许多新的噬菌体家族。然而,自1917年d'Hérelle发现肠道噬菌体以来,我们对噬菌体对肠道微生物群结构影响的了解仍然很少。在几种疾病中观察到病毒群落组成的变化。然而,这些变化是否反映了噬菌体直接参与疾病病因,或者仅仅是细菌成分改变的结果,目前尚不清楚。
在这里,我们概述了肠道噬菌体的当前知识、它们的身份、生活方式以及它们对肠道微生物群的可能影响。我们还收集了噬菌体与免疫系统相互作用的主要数据,特别强调了最近的发现。
参考文献:https://doi.org/10.1038/s41385-019-0250-5
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