怎样命名你发现的噬菌体呢？

  噬菌体分类由国际病毒分类学委员会 (ICTV) 的细菌和古菌病毒小组委员会 (BAVS) 负责。虽然BAVS旨在为噬菌体分类学提供一种整体方法，但对于分离并测序新噬菌体的个别研究人员来说，这可能有点令人不知所措。

  在《Viruses》的一篇文章中为研究人员提供了一个关于噬菌体命名和分类的非正式指南，从噬菌体分离水平采取 “自下而上” 的方法，即是从物种开始。

  目前噬菌体命名的方法主要是，宿主属名，噬菌体单词，加上一个独一无二的标识符号，但是独一无二的标识符号有很多方法，可以包括噬菌体形态和宿主信息。

  Question1:那么命名噬菌体有什么小窍门呢？

  1.使用完整的宿主菌的属名，中间一个空格，噬菌体单词，一个空格，一个独一无二的标符(比如Escherichia phage T4)；

  2.仅使用宿主菌属命名，而不是更高级别菌属，早在2015年BAVS官方已经承认了这种命名方法；

  3.不要将宿主菌名称和噬菌体组成一个单词，例如Mycobacteriophage,Mycophage,等;

  4.不要在名称中使用现存的唯一标符；

  5.不要在名称中使用希腊字母；

  6.不要以数字为唯一标符的开头也不要只使用一个字母，唯一标符需要足够复杂使你的噬菌体名字能明显的区别于别人；

  7.不要使用连字符、斜线、任何形式的特殊字符(比如%、&)，你可以使用下划线，但是你的下划线不能带入BAVS的官网里；

  8.不要使用有争议的名字和句子，不要使用名人的名字，不要使用商贸名字或句子；

  9.如果你有任何问题可以联系BAVS的工作人员。

  Question2:那么当你把发现的噬菌体提交到公共数据库时，你应该怎么办呢？

  1.确实包括所有已提交序列的遗传信息。即使你的噬菌体是最新的而且不属于描述的物种，也需要提供最准确的谱系信息；

  2.没有其他谱系信息可用或可推断时，你需要提供准确的基因组组成信息；

  3.使用“前病毒”位置描述噬菌体；

  4.当你对向INSDC数据库提交的序列有问题时，可以参照GenBank提交手册；

  那么噬菌体该怎么分类呢？欲知噬菌体分类如何，请听下回分解。

  参考文献： Adriaenssens, E. and J.R. Brister, How to Name and Classify Your Phage: An Informal Guide. Viruses, 2017. 9(4): p. 70.