人类进化过程中肠道微生物的变化

　　与人类的近亲物种，例如野生黑猩猩，倭黑猩猩和大猩猩相比，人类肠道微生物组的组成和功能具有细微变化。理解这一变化过程对于理解其发展轨迹背后的进化过程至关重要。

　　深入了解人类与人类近亲物种的肠道微生物组的差异，是探索进化奥秘的重要途径。作者团队跨越两大洲，收集了来自野生类人猿和人类的丰富样本，进行了一场大规模对比研究。研究统计了来自六个国家的珍贵粪便样本，涵盖了两种大猩猩、三种黑猩猩亚种以及稀有的倭黑猩猩。不仅如此，文章还巧妙地结合了刚果共和国的大猩猩和黑猩猩的已有数据，进一步丰富了研究样本。同期开展对人类的肠道微生物进行研究，特别是那些来自科特迪瓦塔霍河地区和刚果民主共和国的乡村人群，他们的肠道微生物群落同样作为研究的关键点。利用这一前所未有的数据宝藏，成功构建了一个详尽无遗的目录，其中包含了高质量的宏基因组数据，并在分类和功能层面进行了精准的注释。

　　人类和野生类人猿粪便微生物组的社区水平特异性。

　　研究结果表明，一些在人类肠道里常见的微生物，在非人类的类人猿肠道中含量下降。每种群体都有自己独特的肠道微生物群风格，就像每个人都有自己的个性签名一样。这好像在告诉我们，在进化的道路上，人类的肠道不断在吸引新的微生物成员加入。但有趣的是，随着人类社会的发展，我们肠道里的微生物多样性却似乎在逐渐减少。这种变化与人类生活水平的提高有着奇妙的联系，甚至包括那些古老的、一直陪伴我们的微生物分支也受到了影响。与此同时，研究还发现，在人类身上，微生物与宿主之间的那种默契的共同进化模式似乎被打破了。

　　以上发现不仅让我们对肠道微生物的个体分类和功能有了更深的认识，还为我们揭示了哪些微生物可能在类人猿肠道微生物组的演变中扮演了关键角色。基因的水平转移、丢失，以及对微妙氧气环境的适应，都在我们肠道微生物组的进化历程中发挥了不小的作用。文章深入探索了人类与非洲大猿肠道中历经千万年进化和共生的粪便微生物群落。西方工业化的生活方式对人类肠道微生物群产生了重大影响，这种变化被视为引发微生物群失衡综合征的关键因素。当快速适应的微生物群与缓慢进化的宿主基因之间出现不匹配时，可能会引发慢性炎症性疾病，如代谢综合征、II型糖尿病和炎症性肠病等。因此，本文所揭示的，人类与非洲大猿肠道微生物群的比较分析，为我们理解人类相关微生物群提供了坚实基础，并为开发个性化的预防和治疗慢性炎症性疾病的靶向干预措施指明了方向。

　　原文链接：https://www.nature.com/articles/s41467-023-44636-7