智能手机实地快速检测单细胞水平HPV
智能手机实地快速检测单细胞水平HPV
摘要:快速人乳头瘤病毒(HPV)筛查是农村地区预防和早期诊断宫颈癌的迫切需要。迄今为止,无法在从临床样本开始的单次患者就诊中实施HPV核酸检测(NAT)。在此,作者开发了一种水凝胶环介导等温扩增(LAMP)方法,在单细胞水平上大规模平行(约1000个细胞)检测临床宫颈脱落细胞中的HPV DNA。可配合热板和智能手机使用,在30分钟内获得HPV NAT结果,特别适用于现场场景。同时将这种快速HPV NAT应用于40个临床宫颈脱落细胞样本,并将结果与临床金标准定量聚合酶链式反应(qPCR)方法[曲线下面积(AUC),1.00]进行比较。同时,作者所提出的方法可以提供大规模平行临床单个宫颈脱落细胞的HPV感染信息,这是传统NAT方法无法获得的。研究结果表明,原位水凝胶LAMP有望成为临床HPV筛查和基础研究的有力工具。
设计思路如下所示:
包括细胞固定化、交联、水凝胶LAMP在内的整个过程可在30分钟内完成。荧光扩增产物位于HPV感染的单个宫颈脱落细胞上。在现场场景中,引入了3D打印智能手机阅读器,用于记录和分析结果。
为了评估ISH LAMP在细胞定量中的性能,作者将HeLa细胞和SiHa细胞稀释为5个浓度组(~ 1 - ~ 1000个细胞/μL)。细胞被热裂解并固定在盖玻璃上,接着进行ISH LAMP。结果如下图所示:荧光点数量与细胞数量呈正相关,扩增子点数与细胞数呈线性拟合,R2相关系数为0.99。
最后对该方法进行了临床上的评价,通过应用40份临床宫颈脱落细胞样本,包括12份hpv18感染样本和12份hpv16感染样本,验证ISH LAMP在高危HPV筛查中的应用性能。
结果表明:使用相同的40个临床样本,显微镜获得的结果与直接从智能手机获得的结果100%一致。这表明智能手机是从临床样本中获得HPV筛查结果的可行策略。智能手机的问世促进了基于ISH lamp的HPV检测适用于更广泛的应用场景,包括各种现场或资源有限的检测。
总结:
1、ISH LAMP检测速度快,易于与便携式设备集成,技术上操作简单,可实现大规模并行单细胞HPV检测;
2、ISH LAMP的性能在40份临床宫颈脱落细胞样本上的检测结果显著,与qPCR金标准方法的一致性为100%。
3、可以直接用商用智能手机输出,这有利于更广泛的应用场景,包括各种现场或资源有限的HPV检测。
参考文献:
Wang J, Jing G, Huang W, et al. Rapid In Situ Hydrogel LAMP for On-Site Large-Scale Parallel Single-Cell HPV Detection[J]. Analytical Chemistry, 2022.
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