实验筛选设计Clostridium novyi-NT孢子萌发剂
诺维梭菌是一种抗癌细菌治疗剂,可在缺氧肿瘤内萌发杀死癌细胞,但诺维梭菌的实际萌发触发因素仍然未知。在这项研究中,使用组合实验设计筛选候选萌发剂,并发现D-缬氨酸是一种有效的萌发剂,在4.2 mM浓度下诱导50% 孢子萌发。L-和D-氨基酸的这种立体柔性效应表明孢子萌发是一个复杂的过程,其中对映体相互作用可能是混杂因素。该研究还确定L-半胱氨酸为萌发剂,次黄嘌呤和肌苷为共萌发剂。其他几种氨基酸以相互作用依赖性方式促进(L-缬氨酸、L-组氨酸、L-苏氨酸和L-丙氨酸)或抑制(L-精氨酸、L-甘氨酸、赖氨酸、L-色氨酸)萌发。D-丙氨酸抑制所有萌发,即使在复杂的生长培养基中也是如此。该工作为提高C. novyi-NT孢子在肿瘤中的萌发功效奠定了基础。
如图1b所示,利用实验设计的原则,组合测试20种氨基酸的组合对诺维梭菌芽孢萌发的作用效果。在组合筛选过程中,确定L-缬氨酸、L-半胱氨酸、L-组氨酸、L-苏氨酸为关键的促萌发因子。而L-精氨酸、L-甘氨酸、赖氨酸、L-色氨酸为萌发的拮抗剂。如图1c所示,在单独筛选实验中,发现L-半胱氨酸及L-丙氨酸有显著的促萌发作用。

图1 促萌发剂的组合筛选及单独筛选
如图2a-c所示,测试了5种有促萌发作用的氨基酸之间的相互作用。组合筛选过程中,确定L-半胱氨酸为显著的促萌发剂。并经过分析,L-半胱氨酸与其他氨基酸的组合并没有显著的促萌发作用。如图2d-f所示,L-精氨酸、L-甘氨酸、L-赖氨酸有效的抑制L-半胱氨酸的促萌发作用。

图2 不同氨基酸之间的相互作用
如图3a-b所示,探究嘌呤衍生物对L-半胱氨酸促进芽孢萌发的协同作用。发现次黄嘌呤和肌苷是显著的共萌发剂。如图3c所示,但是嘌呤衍生物之间没有显著的促进相互作用。

图3 不同嘌呤衍生物之间的相互作用
如图4示,探究D-氨基酸对芽孢萌发的抑制作用。D-半胱氨酸及D-丙氨酸能够有效的抑制芽孢萌发,而D-缬氨酸不能。如图5所示,D-缬氨酸能以极低的浓度促进芽孢萌发。

图4不同D-氨基酸对芽孢萌发的作用

图5 D-缬氨酸是一种促萌发剂
参考文献:https://doi.org/10.1038/s42003-023-04496-9
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