Argonaute介导的DNAzyme串联检测平台实现MRSA现场高灵敏度检测

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来源:曾砚清
2024-08-12 11:00:19
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核心提示:Long Ma团队开发了一种由Argonaute蛋白(一种核酸内切酶,能和gDNA结合用于防御病毒攻击)介导的 DNAzyme串联检测平台(STAND),能同时进行MRSA的超高灵敏度的双基因检测。

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)具有很强的抵抗力和高致死率,已成为全球医院和社区的重要感染病原体。MRSA耐药性来源于位于金黄色葡萄球菌(mec)箱形染色体上的mecA基因,该基因编码一种青霉素结合蛋白(PBP2a),该蛋白可被水解破坏 β-内酰胺类抗生素,进而产生β-内酰胺类抗生素(青霉素、甲氧西林、苯唑西林等)耐药性。及早准确发现MRSA对于指导抗生素的正确使用和控制传染病的传播至关重要。

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在此背景下,Long Ma团队发表在Biosensors and Bioelectronics上的文章《Argonaute-DNAzyme tandem biosensing for highly sensitive and simultaneous dual-gene detection of methicillin-resistant Staphylococcus aureus》报告开发了一种由Argonaute蛋白(一种核酸内切酶,能和gDNA结合用于防御病毒攻击)介导的 DNAzyme串联检测平台(STAND),能同时进行MRSA的超高灵敏度的双基因检测。

STAND 平台的作用原理利用了可编程和靶向激活的核酸酶Pyrococcus furiosus Argonaute(Pf Ago)来识别和切割 MRSA的特异性基因。DNA 酶包含三个组成部分:5’端生物素基团、供Pf Ago识别的短ssDNA、以及未经改造的DNA酶链。

首先,研究者提取了MRSA的全基因组,使用环介导等温扩增(LAMP)扩增了MRSA 特异性基因 mecA 和 nuc,并为 mecA 和 nuc 扩增子设计了三个向导DNA,引导Pf Ago切割靶序列,生成16 nt ssDNA向导。

随后,16 nt ssDNA向导触发了第二次切割,使得生物素基团与 DNA 酶分离。释放出的DNA酶能够切割荧光报告探针,并产生荧光信号。这些由MRSA靶标“开启”的荧光信号可以很容易地被便携式3D打印设备记录下来,适合满足现场检测的需要。

最后,研究者使用MRSA感染动物的粪便和组织样本验证了STAND平台的检测能力。结果发现,STAND平台与金标准方法(PCR)的检测结果一致,而且不同的基质样本对所提出的STAND平台的检测性能没有显著影响。因此,该平台具有监测MRSA检测的一系列情况的能力,具有出色的适应性、特异性和灵敏度。

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