DRT分析突破细菌延迟期检测瓶颈:3.5小时实现早期诊断与抗生素机制解析

DRT分析突破细菌延迟期检测瓶颈:3.5小时实现早期诊断与抗生素机制解析

原创
来源:李康倩
2025-06-19 16:48:09
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核心提示:韩国研究团队通过弛豫时间分布(DRT)技术,首次在细菌延迟期(lag phase)实现早期检测。该方法利用阻抗谱解卷积分离多尺度极化过程,通过特征峰τpeak1(细胞尺寸)和Apeak2(离子浓度)的动态变化,在3.5小时内识别大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和铜绿假单胞菌的延迟期(10-10⁴ CFU/ml),并成功区分美罗培南(细胞壁抑制剂)与四环素(蛋白质合成抑制剂)的作用机制,为快速病原诊断及抗生素研究提供新工具。

1.技术突破:无模型解卷积阻抗谱

传统阻抗谱技术难以分离细菌溶液中叠加的极化响应(培养基、细胞、代谢物)。本研究采用弛豫时间分布(DRT)数学方法,直接从阻抗谱提取多过程贡献,无需预定义等效电路模型:

      基础方程: Z(ω)=R0+0g(τ)1+iωτdτZ(ω)=R0+01+iωτg(τ)dτ,其中 g(τ)g(τ) 为弛豫时间分布函数。

      关键预处理:

1.   Kramers-Kronig检验:筛选残差<0.5%的有效频段(>500 Hz)。

2.   沃伯格元件修正:消除扩散行为干扰,确保DRT仅反映纯极化过程。

      算法实现:基于径向基函数离散化,结合Tikhonov正则化最小二乘法求解。

 

1.阵列芯片的方案。一个数组芯片包含 16 个单独的器件。在玻璃衬底上对宽度为 20 μm、间距为 20 μm 和厚度为 50 nm 的叉指 Au 电极进行图案化。连接一个 300 μl-丙烯酸孔以接种细菌溶液。

2.核心发现:DRT双峰动态指示细菌生长阶段

2.1 特征峰物理意义验证

      培养基DRT图谱:始终存在双峰:

o     1(τpeak16.85 μs):与去离子水极化特征一致,归因双电层响应。

o     2(τpeak2更长):归因培养基分子/离子极化。

      细菌添加的影响:

o     细菌浓度升高使τpeak1向长时间偏移,Apeak2显著降低,且与菌种无关。

 

2.根据 DI 水、不含和含有金黄色葡萄球菌的培养基的 Nyquist 图计算的 DRT。(a) 针对 DI 水测量的奈奎斯特图(黑色符号)和通过减去低频拟合的 Warburg 开路元件(蓝线)获得的校正奈奎斯特图(红色符号)。(b) 根据去离子水(黑色)、不含细胞的无细胞培养基(红色)和浓度为 103 CFU/ml 的金黄色葡萄球菌培养基(蓝色)的校正奈奎斯特图计算的 DRT。(c) 无细胞培养基(黑色符号)和金黄色葡萄球菌浓度为 103 CFU/ml 的培养基(红色符号)的校正 Nyquist 图。校正前的奈奎斯特图如图 S5 所示。(d) 根据不同浓度的金黄色葡萄球菌校正的 Nyquist 图计算的 DRT

 

3.根据在不同浓度的细菌代谢物下测量的数据计算的 DRT。(a) 校正的培养基的 Nyquist 图,不含(黑色符号)和金黄色葡萄球菌生长过程中产生的代谢物(红色符号)。针对 (b) 金黄色葡萄球菌和 (c大肠杆菌生长过程中产生的不同浓度代谢物计算的 DRT。(d) 峰2 ,按总峰面积归一化,与金黄色葡萄球菌和大肠杆菌生长过程中产生的代谢物浓度作图。

2.2 延迟期特异性信号

以金黄色葡萄球菌为例(10³ CFU/ml,):

      延迟期(0-3.5小时):

o     τpeak1减小(Δτpeak1负向变化,)。

o     Apeak2增大(ΔApeak2正向变化,)。

      指数期(>3.5小时):

o     τpeak1增大(细胞分裂导致尺寸增加)。

o   Apeak2减小(代谢物增加离子浓度)。

      普适性验证:铜绿假单胞菌、大肠杆菌均呈现相同规律,且电容突增点与相变时间吻合。

 

4.在不同浓度的金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌和大肠杆菌的细菌生长过程中的 DRT。(a) 在不同时间计算的金黄色葡萄球菌浓度为 10 1 A 2 = τ 峰 1 t) – τ 峰 1 0)), (c) Δ τ 峰 2 = τ 峰 2 t) – τ 峰 2 0)), (d A 1 =A 1 t - A 1 0)) 和 (e A 2 0)) 作为时间的函数,源自不同浓度的金黄色葡萄球菌的 DRT。(f) 金黄色葡萄球菌不同浓度的电容变化 (ΔC = Ct - C 0 =A peak2 t - ) 由初始电容 (C 0 ) 作为时间的函数进行归一化。箭头表示从滞后阶段到指数阶段的过渡。(g) 在不同时间点计算的铜绿假单胞菌浓度为 10 3 CFU/ml DRT。(h) Δ τ 峰1 = τ 峰 1 t) – τ 峰 1 0)) 和 (i A 2 =A 2 t - A 2 0)) 作为时间函数,源自不同浓度铜绿假单胞菌的 DRT。(j) 在不同时间计算的大肠杆菌浓度为 103CFU/ml DRT。(k) Δ τ 峰 1 = τ 峰 1 t) – τ 峰 1 0)) 和 (l A 2 =A 2 t - A 2 0)) 作为时间的函数,源自不同浓度大肠杆菌的 DRT CFU/毫升。

2.3 代谢物实验揭示Apeak2机制

      指数期代谢物溶液使培养基电导升高(阻抗下降)。

      Apeak2与代谢物浓度负相关,证实峰2反映离子浓度变化。

      延迟期Apeak2升高原因:细菌吸收PO³Mo²Fe²等金属离子准备分裂,降低溶液离子浓度。

3. 抗生素机制区分:τpeak1指示细胞尺寸变化

3.1 美罗培南(抑制细胞壁合成)

      MIC=0.1 μg/ml

      高于MIC时:

o     τpeak1显著减小(细胞裂解尺寸缩小)。

o     ΔApeak2不变(代谢停止)。

3.2 四环素(抑制蛋白质合成)

      MIC=1 μg/ml

      高于MIC时:

o     τpeak1轻微增大(细胞尺寸不变)。

o     ΔApeak2不变。

3.3 关键对比

      τpeak1变化差异:美罗培南使τpeak1缩短(尺寸↓),四环素使其增长(尺寸不变或轻微增大)。

      大肠杆菌验证:相同规律。

4. 技术优势与应用前景

      早期检测:在延迟期(传统方法无法检测阶段)即可识别细菌活动。

      机制解析:通过τpeak1变化区分抗生素作用机制(细胞尺寸 vs. 代谢抑制)。

      稳定性控制:同一芯片上多个器件DRT偏差显著小于不同芯片,建议使用同芯片设备保证重现性。

      开源支持:代码已公开(https://github.com/ik80343/DRT_for_bacteria_DRTtools)。

总结

该研究首次将DRT分析应用于细菌生长监测,突破延迟期检测瓶颈,并为抗生素机制研究提供新视角。未来可结合微流控技术开发便携式病原体快速检测设备,推动临床诊断革新。

原文链接:https://doi.org/10.1016/j.electacta.2025.145973

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