基于 LAMP 技术的家禽弯曲杆菌快速检测研究
1.引言
弯曲杆菌是人类急性细菌性胃肠炎的首要致病菌,超过 60% 的英国零售新鲜鸡肉存在该菌污染,高浓度污染(>1000 CFU/g)占比达 11%,对公共健康构成严重威胁。
传统检测依赖培养法,需 3-4 天且需专业实验室支持,无法满足食品供应链实时监测需求;现有快速检测方法(如 PCR、抗体检测)多需 DNA 提取或富集步骤,难以现场部署。
已有的 LAMP 检测试剂盒仍需预富集和复杂离心操作,检测周期长达 23.5-25.5 小时,缺乏真正适用于现场快速筛查的简便方法,亟需优化无需富集、直接检测的技术方案。
(一)实验材料准备
菌株与培养:选用空肠弯曲杆菌(NCTC 11168)和大肠弯曲杆菌(NCTC 11350),在 41.5±1℃微需氧条件下(5% O₂、10% CO₂、85% N₂)培养 48 小时。
样本类型:包括家禽屠体海绵拭子(鸡、火鸡)、禽舍靴拭子,部分样本经 SonoSteam®(蒸汽 + 超声)处理用于评估去污效果。
(二)样本预处理流程
屠体拭子:将预湿拭子反复按压洗脱,取 500μl 洗脱液 85℃加热 5 分钟,直接取 5μl 作为 LAMP 反应模板,无需 DNA 纯化。
靴拭子:用 100mL PBST 缓冲液重悬后振荡 30 秒,四倍稀释后与等体积 0.3M KOH 混合,85℃加热 5 分钟,取 5μl 用于反应。
(三)LAMP 检测体系优化
靶向基因:选择嗜热弯曲杆菌属 16S rRNA 基因序列设计引物,包括 FIP、BIP 等特异性引物(表 1)。
内部扩增对照(IAC):设计退火温度(92.5℃)与目标扩增子(88℃)差异显著的 IAC 序列(图 1),终浓度 340 拷贝 / 反应,排除扩增抑制剂导致的假阴性。
反应条件:使用 ISO-004 等温反应混合物,65℃恒温反应 60 分钟,后续经 98℃加热后以 0.05℃/ 秒冷却至 80℃,通过退火曲线分析结果。
(四)方法验证方案
人工污染实验:向无菌火鸡拭子添加不同浓度(10¹-10⁵ CFU / 拭子)的弯曲杆菌,验证检测限。
平行对比实验:171 份自然污染屠体拭子、若干靴拭子分别用优化 LAMP 法与传统培养计数法(基于 ISO/TS 10272 标准)检测,对比一致性。
2.结果与讨论
(一)IAC 与检测限性能
IAC 特异性良好:退火曲线中 IAC 峰值(92.5℃)与目标峰值(88℃)清晰区分,阴性样本仅出现 IAC 单一峰值(图 2),有效监控扩增有效性。
检测限明确:人工污染样本中,该方法可稳定检测到 10⁴ CFU / 拭子,部分实验中可低至 10³ CFU / 拭子;自然污染样本中,≥800 CFU / 拭子的样本检测阳性率达 100%。
(二)自然污染样本检测结果
屠体拭子:70 份培养法阴性(≤10 CFU / 拭子)样本中,LAMP 法仅 1 份假阳性(阳性率 1.4%);400-760 CFU / 拭子样本阳性率 45.4%,随细菌浓度降低阳性率逐渐下降(表 3)。
靴拭子:可检测到≥30 CFU/g 的污染,与培养法结果趋势一致,适用于禽舍环境监测(表 5)。
SonoSteam® 处理评估:处理前阳性鸡群样本 LAMP 检测全为阳性,处理后 15 份样本中 14 份阴性,与培养法结果相符,可用于去污效果监测(表 4)。
(三)方法适用性
无需富集与 DNA 纯化,仅需热块和便携式仪器,1 小时内出结果,可在农场、屠宰场、零售端等现场部署。
耐受复杂基质干扰,对含粪便、垫料等杂质的靴拭子仍有效,且可拓展至牛屠体等其他样本类型。
图 1:内部扩增对照(IAC)DNA 序列
核心作用:作为扩增过程的内参,验证反应体系是否受抑制剂干扰。
设计特点:序列经优化后,退火温度与目标基因差异显著(4.5℃),确保在退火曲线中可明确区分,避免与目标信号混淆。
图 2:LAMP 扩增后退火曲线
曲线解读:横坐标为温度,纵坐标为荧光信号变化率,不同曲线对应不同样本类型。
关键信息:阳性对照(纯化弯曲杆菌 DNA)出现双峰值(88℃目标峰 + 92.5℃ IAC 峰);污染样本(18 号)同样显示双峰值;阴性样本(17 号)和空白对照仅出现 92.5℃ IAC 峰,直观区分样本污染状态。
表 1:弯曲杆菌 LAMP 引物序列与浓度
内容说明:列出 6 种特异性引物的序列、终浓度及参考来源,包括正向 / 反向内引物(FIP/BIP)、环引物(F-Loop/B-Loop)等。
应用价值:引物组合靶向 16S rRNA 基因,确保检测特异性,各引物浓度经优化后平衡扩增效率与特异性。
表 2:人工污染拭子的 LAMP 检测结果
数据逻辑:横向为污染浓度(10¹-10⁵ CFU / 拭子),纵向为阳性样本数 / 检测样本数。
核心结论:10⁴ CFU / 拭子及以上浓度时,检测阳性率 100%;10³ CFU / 拭子阳性率 40%;10² CFU / 拭子及以下均为阴性,明确方法检测下限。
表 3-5:自然污染样本检测对比表
表 3(屠体拭子):按培养法计数分组,呈现不同浓度区间的 LAMP 阳性率,体现浓度与阳性率的相关性。
表 4(SonoSteam® 处理样本):对比处理前后 LAMP 与培养法结果,验证方法对去污效果的监测能力,处理后阳性率显著下降。
表 5(靴拭子):小样本验证显示,LAMP 法可检测≥30 CFU/g 的污染,适用于禽舍环境污染筛查。
4.总体结论
该研究成功开发了一种快速、简便的 LAMP 检测方法,无需富集培养和 DNA 纯化步骤,结合 IAC 有效避免假阴性,1 小时内即可完成家禽样本中弯曲杆菌的检测。其检测性能与传统培养法高度一致,可稳定识别高浓度污染(≥800 CFU / 拭子),适用于家禽生产全链条的现场筛查,能帮助快速评估生物安全措施效果、监控去污处理成效,为减少弯曲杆菌食源性传播提供技术支持。尽管对低浓度污染(<800 CFU / 拭子)的检测灵敏度有限,但已满足欧盟推荐的加工卫生标准(1000 CFU/g 皮肤)监测需求,具备规模化应用潜力。
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