冻干纸芯片携手CRISPR,智能手机45分钟“揪出”诺如病毒

原创
来源:蔡伟程
2026-03-19 16:06:20
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核心提示:该研究开发了一种创新的冻干纸芯片(lpRPA-Cas)检测平台,用于诺如病毒的现场快速检测。该平台将RT-RPA等温扩增与CRISPR/Cas12a技术集成于一张芯片,通过冻干工艺实现试剂常温长期稳定。检测在45分钟内完成,灵敏度高达1拷贝/微升,且特异性强。

引言:食品安全与公共卫生的“隐形威胁”

诺如病毒(Norovirus, NoV)是全球范围内食源性疾病的主要元凶,也是引发急性非细菌性肠胃炎的首要病原体。其传染性强、感染剂量低、环境稳定性高的特点,使其成为持续的公共卫生挑战。无论是受污染的饮用水、生鲜蔬菜还是贝类水产品,都可能成为诺如病毒传播的媒介。因此,开发快速、灵敏、且适用于现场(point-of-care, POC)的检测手段,对于及时控制疫情、保障食品安全至关重要。

然而,传统的金标准检测方法,如定量聚合酶链式反应(qPCR),虽精准却依赖昂贵的仪器、专业的操作人员和复杂的实验室环境,难以在资源有限地区、食品加工现场或疫情暴发一线快速部署。

创新融合:当冻干纸芯片遇上CRISPR/ Cas12a

近日,天津科技大学尹丽娟团队在《Chemical Engineering Journal》上发表了一项突破性研究,他们成功开发了一种名为 “lpRPA-Cas” 的冻干纸基微流控分析平台。该平台巧妙地将逆转录重组酶聚合酶扩增(RT-RPA) 与CRISPR/Cas12a基因编辑技术集成在一张小小的纸芯片上,并辅以智能手机便携式荧光检测装置,实现了对诺如病毒的高灵敏、高特异性、快速现场检测。

技术原理:三步走,化繁为简

该平台的检测流程高度集成和简化,主要分为三个核心步骤:

1.  等温扩增:将可能含有诺如病毒RNA的样本滴加到纸芯片上预冻干的RT-RPA反应区。在37°C恒温下,RT-RPA技术可在15分钟内将极微量的目标病毒RNA片段进行指数级扩增,无需传统PCR的热循环仪器。

2.  CRISPR识别与信号放大:完成扩增后,将纸芯片对折,使扩增产物与预冻干在另一区域的CRISPR/Cas12a系统接触。Cas12a蛋白在向导RNAcrRNA)的引导下,能特异性识别并结合扩增产物中的目标序列。一旦成功结合,Cas12a酶被激活,展现出“附属切割”活性,无差别地切割周围带有“荧光报告-淬灭”对的单链DNA探针,从而释放出荧光信号。

3.  智能手机读值:产生的荧光信号由一个定制的小型便携设备激发和捕获。该设备集成了加热模块、LED光源和滤光片,并使用智能手机摄像头拍照,再通过手机上的图像分析软件(如ImageJ)定量荧光强度,直接得出检测结果。

1 lpRPA-Cas平台检测原理示意图。展示“样本加入-RPA扩增-折叠芯片-CRISPR反应-荧光检测”的完整流程。

核心优势:冻干工艺实现常温稳定与便携

该研究最大的亮点之一在于冻干(冷冻干燥)工艺的应用。研究团队将RT-RPA反应试剂与CRISPR/Cas12a系统分别冻干固化在纸芯片的特定区域。这一处理带来了革命性的优势:

•无需冷链:冻干试剂在室温下可长期保持活性。实验证明,制备好的冻干纸芯片在室温(约25°C)下储存8周后,其检测性能依然稳定可靠。这彻底摆脱了对昂贵冷链运输和储存的依赖。

•操作极简:用户只需加入样本和启动试剂所需的缓冲液,折叠芯片并放入便携加热装置,后续反应全部在芯片上自动完成。极大地降低了操作门槛和污染风险。

•高度集成:所有生化试剂均预装于一次性纸芯片上,实现了“样品进,结果出”的一体化设计。

2 所构建检测平台的可行性验证与条件优化。(A)不同 RPA 引物下 RPA-CRISPR 反应的荧光强度及信噪比;(BC)用于评价 CRISPR 系统中不同 crRNA 性能的荧光动力学曲线(B)和反应 50 min 时的荧光强度(C);(D)冻干保护剂的筛选优化;(EF)不同纸基衬底的背景荧光对比(E)及检测性能对比(F);(G)平台可行性验证及 Cas12a 蛋白浓度的优化;(HCRISPR/Cas12a 切割反应时间的优化。Δ 荧光强度为实测荧光强度扣除背景荧光强度计算所得。

3. 卓越性能:灵敏度、特异性与实战检验

经严格测试,该平台展现出优异的分析性能:

•超高灵敏度:对诺如病毒RNA的检测限低至1 拷贝/微升,在45分钟内即可完成从检测到出结果的全过程。检测信号在宽达7个数量级(10^1 10^7 拷贝/微升)的浓度范围内与病毒浓度呈现良好的线性关系,可用于准确定量。

•高特异性:针对沙门氏菌、金黄色葡萄球菌B族链球菌、白色念珠菌、SARS-CoV-2、单纯疱疹病毒、人乳头瘤病毒、轮状病毒及人类基因组DNA等多种常见干扰物进行测试,结果均无交叉反应,仅对诺如病毒产生强烈的荧光信号。

3 该平台检测诺如病毒 RNA 的性能表征。(A~CCRISPR/Cas12a 反应不同时间点下,平台对诺如病毒 RNA 的检测灵敏度;(D)荧光强度与诺如病毒 RNA 浓度的相关性分析;(E)平台检测诺如病毒的特异性 —— 与其他干扰性病毒、细菌、真菌及人类基因组的区分能力;(F)冻干纸基 RPA-CRISPR 检测体系对诺如病毒 RNA1 拷贝 / 微升)的 8 周稳定性及保质期评估。实验设 3 次技术重复,柱状图数据以均值 ± 标准差表示;采用双尾 t 检验进行统计学分析,*p<0.05**p<0.01***p<0.001

•实际样本验证:研究团队在自来水、生菜匀浆液和牡蛎消化腺匀浆液等复杂实际样本中添加诺如病毒进行检测,灵敏度均保持在1 拷贝/微升。更重要的是,对从市场采购的9份真实牡蛎样本进行盲测,该平台的结果与标准RT-qPCR方法的符合率达到100%,成功检出所有阳性样本。

4 冻干纸基 RPA-Cas 检测平台在实际样本中检测诺如病毒的应用研究。(A)环境与食品样本中诺如病毒的检测流程;(B~D)诺如病毒 RNA 不同浓度人工污染样本的检测结果,分别为自来水基质(B)、生菜基质(C)、牡蛎基质(D);(E)牡蛎消化腺及其匀浆液的实物图;(F)冻干纸基 RPA-Cas 检测平台与逆转录荧光定量 PCR 技术检测 9 份牡蛎样本诺如病毒的性能对比,其中阳性样本 6 份、阴性样本 3 份;(G)冻干纸基 RPA-Cas 检测平台与逆转录荧光定量 PCR 检测结果的韦恩图对比。实验设 3 次技术重复,柱状图数据以均值 ± 标准差表示;采用双尾 t 检验进行统计学分析,*p<0.05**p<0.01***p<0.001

4. 便携化设计:智能手机赋能现场快检

为实现真正的现场即时检测,团队研发了一款智能手机集成的便携式检测设备。该设备尺寸仅约90x60x50毫米,内置加热模块和特定波长的LED光源,并由充电电池供电。检测时,将反应后的纸芯片放入设备,由智能手机摄像头拍摄荧光图片并利用内置软件进行分析,结果直观可见。

5 A)智能手机辅助便携式检测装置结构示意图;(B)便携式检测装置实物图;(C)便携式检测装置对不同浓度诺如病毒 RNA 检测的荧光强度结果;(D)便携式检测装置与实验室仪器检测所得荧光强度的线性关系;(E)便携式检测装置对 9 份牡蛎样本检测的荧光强度结果。注:FI 为荧光强度的缩写;误差棒代表 3 次重复实验结果的标准差(n=3);采用非配对双尾 t 检验进行统计学显著性分析:无显著性差异(NSP>0.05),极显著性差异(P<0.001)。

总结与展望

这项研究成功构建了一个集冻干稳定、操作简单、快速灵敏、设备便携于一体的诺如病毒现场检测新范式。lpRPA-Cas平台不仅为食源性诺如病毒的监测提供了强有力的工具,其“冻干纸芯片+CRISPR+智能手机检测”的架构具有高度的通用性和可扩展性。通过更换针对性的引物和crRNA,该平台有望被快速应用于其他食源性病原体(如沙门氏菌、李斯特菌)、传染病原(如流感病毒、登革热病毒)乃至动物疫病的现场快速诊断,在食品安全监管、口岸检疫、基层医疗和家庭健康监测等领域具有广阔的应用前景。

 参考文献:

Yin L, Wang L, Yin L, et al. A lyophilized paper-based platform integrating RT-RPA and CRISPR/Cas12a for smartphone-assisted point-of-care detection of norovirus in environmental and food samples[J]. Chemical Engineering Journal, 2026: 172832.

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