基因组学设计新引物检测克罗诺杆菌

首尔大学Jae-Ik Lee 最近发表了一项研究成果，其目的是在比较基因组学的基础上开发新的检测阪崎克罗诺杆菌的引物探针组。在panX分析结果的16个候选基因簇中，选择注释为1型菌毛蛋白的基因作为引物的靶标，并用59株菌株证实了所设计引物的敏感性/选择性。以胰蛋白酶大豆肉汤（TSB）、磷酸盐缓冲盐水（PBS）、肠杆菌科富集物（EE）和大肠杆菌DNA为干扰材料，除50%EE外，其余化合物对阪崎肠杆菌的检测均无显著影响。此外，验证了在婴儿配方奶粉（PIF）、含有乳杆菌的PIF和牛奶等食品样品中使用设计引物进行PCR分析的检测效率与传统使用的选择性培养基没有显著差异。这些结果表明，基于比较基因组学设计的引物可以有效地用于检测各种食品中的阪崎肠杆菌。

参考文献：

Jae-Ik Lee, Sang-Soon Kim, Dong-Hyun Kang. Development of DNA probes to detect Cronobactersakazakiibased on comparative genomics and its application in food samples. Food Control. 2022. 137: 108853.

DOI: 10.1016/j.foodcont.2022.108853