双肽(Ⅱb 类)细菌素简介

原创
来源:叶庆磊
2024-07-29 11:32:37
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核心提示:GxxxG 基序与类GxxxG 基序常见于跨膜结构域(TMD),与跨膜结构的α-螺旋形成密切相关,这在双肽细菌素的结构研究中得到了证实。

双肽(IIb 类)细菌素通常是由革兰氏阳性菌产生的热稳定小分子(<10 kDa)双组分抗菌肽,该类肽能够依靠特定模式基序介导肽-肽互作,形成拥有跨膜能力的活性二聚体蛋白。于1992年发现的乳球菌素是第一中Ⅱb 类细菌素,其特点是需要两条互补多肽同时存在才能发挥抑菌活性。

目前,已经有数十种双肽(IIb 类)细菌素被表征,其氨基酸序列中均包含至少一个“GxxxG”基序或“类 GxxxG”基序,这些模式基序通常被描述为两端为甘氨酸、中间为三位随机小取代基氨基酸的五肽序列,当端位甘氨酸被替换为结构相似的丙氨酸或丝氨酸时,被称为“类 GxxxG”基序。虽然模式基序广泛存在于双肽细菌素中,但只有部分控制着双肽细菌素的活性核心,其余则很少对细菌素的活性产生决定性作用。

GxxxG 基序与类GxxxG 基序常见于跨膜结构域(TMD),与跨膜结构的α-螺旋形成密切相关,这在双肽细菌素的结构研究中得到了证实。研究表明,在α-螺旋结构中,特征基序两端的小取代基氨基酸(G/S/A)会在螺旋结构中占据同侧位置,使螺旋结构在一侧形成便于彼此靠近的区域,以CbnX、PlnK、Pls-α 和 PlnF 中连续的 GxxxG/类 GxxxG 基序为例(图 1),基序端位的氨基酸在多肽的同侧形成了平台区域,该区域有助于形成范德华相互作用或形成较为稳定的螺旋间 Cα—H…O 氢键。

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基于CD和NMR技术研究发现,双肽细菌素的任意一条成熟肽在水溶液中通常没有明确结构(图2A),但当其暴露于膜样实体(三氟乙醇、胶束或脂质体)环境,肽链就会出现螺旋结构,而当两条肽链混合后置于膜样实体环境中时,两条肽链的结构又会相互诱导出现进一步的变化(图2B)。以乳球菌素G为例,两条多肽在单独存在时,微摩尔浓度下均未检出活性,而同时存在时,浓度降低到纳摩尔仍具有抑菌活性。结构与活性分析表明,双肽细菌素的两条多肽间存在显著的依赖性,当它存在于膜样实体环境中时,通过螺旋-螺旋互作形成一个独立的抗菌单元,而不是分别作用于靶细胞上的不同位点。在膜电位的影响下,由两条多肽形成的螺旋-螺旋结构凭借其端位的阳离子区域强制穿过靶细胞膜,从而将细菌素的一端定位在靶细胞内(图2B、C)。Kjos 等于2014年率先通过抗性突变体分析手段推测UppP蛋白(一种参与肽聚糖合成的膜蛋白)是乳球菌素G和粪肠球菌素1071的可能受体,首次证明了双肽细菌素依赖于受体的二聚体抗菌肽(图2D)。现有研究普遍认为,双肽细菌素是通过改变靶细胞膜对小分子的渗透性来达到抑菌效果,且不同的细菌素带来的靶细胞膜变化并不完全相同(图 2E)。

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