蜡样芽胞杆菌类群在自然界中普遍存在，并且各有用途，包括众所周知的炭疽杆菌和蜡样芽胞杆菌，以及苏云金芽胞杆菌。蜡样芽胞杆菌类群的成员能够引起人类疾病的发生，主要是三种症状：炭疽、呕吐综合征和腹泻综合征。

  苏云金芽胞杆菌是一种普遍存在土壤里的细菌，其特征在于产生具有杀虫活性的蛋白质晶体，这是一种流行的生物农药，已在全球范围内使用了数十年，被认为对人类无致病性。其蛋白质晶体是在芽胞形成的过程中形成的，并由来自Cry或Cyt家族的毒素组成。其作用机制是昆虫摄入后毒素就会被蛋白水解激活。Cry毒素单体随后与中肠上皮细胞膜中的特定受体结合并自组装成膜孔，导致渗透裂解并最终导致幼虫死亡 。而Cyt毒素非特异性结合并整合到宿主细胞膜中，并假定通过孔形成或通过破坏膜结构发挥作用。

  基于苏云金芽胞杆菌的配方含有杀虫毒素和芽胞的混合物，并在新鲜或加工过的植物源性食品中经常发现生物农药残留，而其残留的芽胞或营养态的细胞被认为可能导致人类疾病发生因素，虽然食品监管机构传统上认为使用苏云金芽孢杆菌生物杀虫剂是安全的，但蜡样芽胞杆菌类群研究的最新进展表明大规模基因组分析显示苏云金芽胞杆菌存在于各种蜡样芽胞杆菌类群进化枝中，说明苏云金芽胞杆菌与其他蜡样芽胞杆菌组成员共同遗传背景，而不是形成一个单独的分类单元；而商业销售的苏云金芽孢杆菌生物农药菌株被证明会产生肠毒素Hbl、Nhe 和CytK；目前报告了多起因苏云金芽孢杆菌引起食源性疾病暴发。