研究突破:开发基于糖基化细胞外囊泡衍生的miRNA签名,用于早期检测食管鳞癌
食管鳞癌(ESCC)是全球常见的癌症之一,尤其在中国等非西方国家发病率较高。由于缺乏非侵入性早期检测工具,ESCC多在晚期才被诊断,导致患者预后不佳,5年生存率仅为15%至25%。早期诊断和及时干预对于改善患者生存率至关重要。然而,传统的内镜和黏膜活检方法因成本高、操作复杂且具有侵入性,无法用于ESCC的常规筛查。因此,开发新的早期诊断标志物迫在眉睫。
在此背景下,研究团队聚焦于液体活检中的EVs。EVs是细胞分泌的微小囊泡,富含肿瘤特异性成分,且在血浆等体液中含量丰富、稳定性高、易于获取。研究发现,肿瘤细胞的糖基化修饰异常,尤其是唾液酸化和岩藻糖基化,与肿瘤的发生、发展密切相关。基于此,研究团队利用岩藻糖基化(Fuc-)和唾液酸化(Sia-)的EVs捕获策略,深入探究肿瘤来源的EVs中的miRNA水平。
研究结果

图 1 利用小RNA测序鉴定预测食管鳞癌患者的糖基化EVs衍生miRNA
如图1,展示了利用小RNA测序鉴定糖基化EVs衍生miRNA以预测ESCC患者的流程,还有Fuc-EVs和Sia-EVs发现队列中差异表达miRNA的火山图、热图,能直观呈现miRNA的筛选过程和表达差异情况。研究共纳入371例ESCC患者和303例健康对照者,通过多中心、多阶段的病例对照研究,利用扁豆凝集素(LCA)和小麦胚芽凝集素(WGA)包被的磁珠,分别分离Fuc-EVs和Sia-EVs。

图 2 在内部验证队列和外部验证队列中评估糖基化EVs DEmiRNAs基础面板的性能
图2A,B分别展示了内部验证队列和外部验证队列中ESCC患者与健康对照的7个DEmiRNAs的代表性热图。而图2C,D利用ROC曲线分析,分别展示了在内部验证队列和外部验证队列中RiskscoreFuc−、RiskscoreSia−和RiskscoreFuc−&Sia−的诊断性能。经过生物标志物发现、筛选、训练、内部验证和外部验证等步骤,确定了7个差异表达的miRNA,并构建了基于糖基化EVs衍生miRNA的诊断模型。

图 3 糖基化EVs衍生miRNA签名的构建及诊断性能评估
图3展示了构建糖基化EVs差异表达miRNA(DEmiRNAs)特征并评估其在训练队列中的诊断能力,通过受试者工作特征曲线(ROC)和瀑布图展示不同风险评分(RiskscoreFuc-、RiskscoreSia-、RiskscoreFuc-&Sia-)在ESCC患者和健康对照者血清样本中的诊断性能和分布。
结果显示,该诊断模型(RiskscoreFuc-&Sia-)在各阶段ESCC的检测中表现卓越。在训练队列、内部验证队列和外部多中心验证队列中,其受试者工作特征曲线下面积(AUC)分别达到0.980、0.957和0.973,显著高于CEA(训练队列AUC=0.769;内部验证队列AUC=0.749;外部验证队列AUC=0.765)。在检测CEA阴性(CEA<5ng/ml)的ESCC病例时,该模型同样表现出色,训练及内部验证队列AUC为0.974,外部多中心验证队列AUC为0.973。此外,在区分早期ESCC患者方面,模型的效能也十分强大,训练队列AUC=0.982,外部多中心验证队列AUC=0.977。

图 4 糖基化EVs衍生miRNA特征(RiskscoreFuc-&Sia-)与CEA联合诊断的性能
研究还发现,将RiskscoreFuc-&Sia-与CEA联合使用,可进一步提高诊断准确性。在训练队列中,CEA单独检测时AUC为0.769,联合RiskscoreFuc-&Sia-后AUC提升至0.989,内部验证队列和外部验证队列也有类似提升。决策曲线分析表明,联合检测在多数诊断阈值概率范围内,能提供更高的净收益。
从技术层面来看,研究采用的糖基化EVs捕获策略可有效富集肿瘤来源的EVs,自动化提取方法提高了实验效率和可控性,逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)保证了miRNA分析的准确性,增强了该检测方法向临床分子诊断转化的可行性。
研究还指出,糖基化EVs的分离技术在临床转化中面临成本较高的挑战,主要源于高质量凝集素的使用,但随着技术进步,这一问题有望得到解决。未来研究可从不同人群生物靶点开发、癌症全阶段监测等方面展开,进一步优化诊断模型。总体而言,该研究为ESCC的早期检测提供了一种潜在的高效方法,有望改善食管癌患者的诊疗现状,相关成果也为多种癌症的早期诊断模型开发提供了理论和实践依据。
原文链接:https://doi.org/10.1186/s12916-025-03871-z
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