相较于蛋白质、脂质、碳水化物等食品主要成分，人们较少关注食品中的微量成分。但它们对机体来说，又是必不可少的。随着研究的深入，科学家们发现微量成分和肠道菌群藏着一些秘密。

  有研究将来源于人类的细菌转移至无菌小鼠，前后2周喂养营养素充足食物，中间3周分别喂养缺乏维生素A、叶酸、铁和锌的食物，这些营养素的缺乏对菌群产生显著影响。其中急性维生素A缺乏与体内胆汁酸代谢有关，使得普通拟杆菌丰度明显增加，产生大量维生素A以适应环境。

  以微量元素锌为例，作为人体必需微量元素，即使是轻微的锌缺乏也可以深刻影响机体的生长发育，并且阻碍免疫分化和成熟。以小鸡为动物模型的研究表明，锌缺乏会导致肠道菌群发生显著变化，进而影响代谢产物，如短链脂肪酸的产生减少。

  此外，有一些研究表明，预防剂量的锌在不同的动物模型中均使肠道中细菌多样性、革兰氏阴性厌氧菌、短链脂肪酸含量增加。其它研究也表明。

  多酚是在植物性食品中发现的、具有潜在促进健康作用的化合物，存在于一些常见的植物性食物，如可可豆、红酒、大豆、蔬菜和水果中。

  多酚作为一种抗氧化剂，具有较好的清除自由基的作用，从而对机体慢性病起到预防作用。膳食多酚，包括儿茶素、黄酮醇、花青素、原花青素等，已有大量研究证实它们对机体有积极的抗氧化作用。进一步研究发现，食用可可豆可以显著增加血浆高密度脂蛋白，显著降低血浆三酰甘油和C反应蛋白浓度。

  肠道菌群关联研究发现，多酚通过抑制有害菌、促进有益菌生长而保持肠道稳态。

  有研究表明，食用富含多酚的食物可以增加肠道中双歧杆菌和乳杆菌的相对含量;鞣花丹宁补充结果表明，鞣花丹宁的补充可以促进AKK菌、丁酸弧菌的生长。

  槲皮素补充结果表明，槲皮素的摄入可以显著改变肠道菌群组成，并且抑制与肥胖相关细菌的生长，如韦荣球菌、芽孢杆菌和圆柱形真杆菌。

  并且多酚具有很强的抑菌作用，可以抑制金黄色葡萄球菌和伤寒沙门氏菌的生长。

  此外，食用水果、红酒、绿茶等富含多酚的食品后，均观察到相关梭菌含量的降低。

  食品添加剂是为改善食色、香、味等品质，以及为防腐和加工工艺的需要而加入食品中的人工合成或者天然物质。食品添加剂不能单独作为食品食用，添加量有严格限定标准。

  人造甜味剂就是用化学方法合成的一类有甜味的化合物，比如糖精、蔗糖素、阿斯巴甜、安赛蜜等。这些甜味剂甜度高，几乎无热量，而且不会使血糖升高，具有许多优点。