食源性疾病是目前全球最关键的食品安全问题，对人类健康和经济造成严重危害,据世界卫生组织(WHO)统计，发达国家每年约有30%的人口患有食源性疾病，发展中国家的情况更为严重。全球每年约有6亿例食源性疾病病例，死亡人数高达42万，其中12.5万例为5岁以下儿童。然而，大多数食源性疾病是由微生物污染引起的。其中病毒污染是世界食源性疾病的重要原因。

  诺如病毒(Noruvirus, NoV)因其感染剂量低、传播途径广、耐环境性强等特点，是目前最重要的食源性病毒，极易污染水果、莴苣和贝类，引起食源性疾病的暴发，一般来说，诺如病毒在较冷的天气中传播，并引起呕吐、腹泻和腹痛等胃肠道症状。在医院、疗养院和学校等半封闭机构中经常报告暴发。2016-2017年，新型重组毒株GII.P16-GII.2突然出现，并在接下来的几年中成为中国和世界范围内的优势毒株。为了更好地掌握GII.P16 - GII.2的起源和传播。研究人员进行了分子进化分析，包括系统动力学和系统地理学。

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  时间尺度的系统发育树表明，GII.P16 - GII.2主要衣壳蛋白(VP1)基因到最近共同祖先的时间与GII.P2 - GII.2基因在2001发生了分化，进化速率为3.32×10-3替换/位点/年。GII.P16 - GII.2 RNA依赖性RNA聚合酶区域(RdRp)基因到最近共同祖先的时间与GII.P16 - GII.4基因在2013发生了分化，进化速率为9.44×10-3替换/位点/年。在这2个基因区域中，VP1基因序列变异受选择压力的影响最大。系统地理学分析表明，中国的GII.P16-GII.2毒株与美国、澳大利亚、泰国和俄罗斯的毒株交流最频繁。

  在中国，最早的GII.P16-GII.2诺如病毒可能通过两条途径进入，一条从澳大利亚到台湾，另一条从美国到广东，而不是从日本和韩国进入，后者在地理上更接近中国，并且且发现的病例更多。VP1和RdRp基因区域的系统动力学分析表明，中国、日本和韩国的菌株没有分成同一个簇，而是相邻的簇，这似乎证实了这一点。这表明，由于诺如病毒具有高度传染性，可以通过受污染的水、空气、食物和其他物品传播，因此地理隔离不会阻碍其空间和时间传播。而且，因为这个新出现的GII.P16-GII.2诺如病毒从广东传播到邻近地区和中国北方，包括浙江、河南、香港和北京。最后，数据表明，GII.P16-GII.2诺如病毒从华北(北京)、华南(广东)和东南(浙江省和江苏省)3个流行中心向中国其他地区传播。在这3个地区，人口流动是一个共同特征，广东、深圳、浙江和江苏是沿海地区。其中，广东有报道称与多种基因型诺如病毒的进化和传播有关，包括首次重新出现的GII.P16-GII.2诺如病毒。诺如病毒的散发病例和社区暴发在沿海地区很常见的原因是，它通常与食用受粪便污染的贝类有关。总体而言，考虑到感染风险，应加强对贝类安全和人口稠密城市的监测。

  内容和数据来源自文章《Early evolution and transmission of GII.P16-GII.2 norovirus in China》