猪肠道噬菌体组是毒力基因的重要宿主和转移载体

  近日，吉林大学人畜共患传染病诊治国家重点实验室在Science of The Total Environment上发表了一篇关于猪肠道噬菌体的相关文章。

  本文从59955个断奶仔猪肠道噬菌体基因组中鉴定出185个毒力基因，其中0.688%的噬菌体重叠群编码至少一个毒力基因。毒力基因pblA最为丰富，各种毒力基因与肠道噬菌体及其编码的移动基因元件基因(转座酶/重组酶)显著相关。重要的是，多个毒力基因和移动基因元件基因共存于一些噬菌体序列中，在单个噬菌体序列中检测到多达12个毒力基因，大大增加了噬菌体介导的毒力基因向细菌基因组中传播的风险。

  此外，作者还发现，在腹泻导致断奶仔猪肠道中，噬菌体和细菌群落的组成和结构发生变化，同时显著增加了粪便样本中编码毒力基因和移动基因元件基因的噬菌体重叠群的丰度，这可能会增加噬菌体介导的毒力基因转染肠道细菌基因组的风险。

  作者的研究表明，猪肠道噬菌体是毒力基因的重要宿主和潜在的转移工具。在这项研究中，作者纯化了病毒颗粒，通过严格的方法提取了病毒核酸，并使用多个数据库和新方法严格鉴定了病毒序列。这些过程降低了非病毒DNA来源的毒力基因污染的可能性。然而，该研究主要依赖于宏基因组学和生物信息学方法，这些方法受到临界阈值和选定数据库的影响。强烈建议在未来的研究中应用深入的功能生物信息学分析，并产生更直接的证据，如实验室和田间条件下病毒毒力基因的基因表达和细胞毒性评估，这将有助于定量估计猪肠道噬菌体对毒力基因传播的贡献。

  参考文献：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0048969724002109