代谢决定命运:α-酮戊二酸在肠道组织再生中的调控作用
近年来,代谢重编程逐渐被认为不仅仅是细胞应激或肿瘤适应性的一种结果,更是细胞命运调控的关键参与者。α-酮戊二酸(α-ketoglutarate, αKG)作为三羧酸(TCA)循环的中间产物,在能量代谢、氨基酸合成及表观遗传修饰中均扮演重要角色。然而,其在组织再生过程中是否具有决定细胞分化方向的能力,尚不明确。2025年6月11日,纪念斯隆-凯特琳癌症中心的Scott W. Lowe课题组在《Nature》期刊发表的研究《Metabolic adaptations direct cell fate during tissue regeneration》对此问题进行了系统而深入的探讨。该研究揭示了αKG代谢通路在小鼠肠道再生中的关键调控作用,并提出调控代谢状态可有效引导干细胞向特定谱系分化,为组织修复提供了新的代谢干预策略。
本研究由Almudena Chaves-Perez等人主导完成,2025年6月11日在线发表于《Nature》。研究团队通过多中心合作,综合运用单细胞转录组测序(scRNA-seq)、类器官培养、代谢流分析、CRISPR干扰技术及动物模型实验,系统分析了OGDH(αKG脱氢酶)在肠道上皮不同细胞类型中的表达特征与功能,发现OGDH在肠道上皮细胞中呈现谱系特异性表达:在以吸收功能为主的肠上皮细胞(如肠上皮吸收细胞)中表达显著上调,而在分泌系细胞(如杯状细胞、潘氏细胞等)中则被下调。该异质性提示OGDH可能在肠道干细胞的谱系分化过程中发挥调控作用。
研究首先在小鼠小肠组织中通过单细胞RNA测序分析了TCA循环关键酶的表达谱,发现OGDH及其辅助蛋白DLST、DLD的表达与吸收细胞密切相关。随后,研究者利用CRISPRi技术和小分子抑制剂(如devimistat)抑制OGDH活性,发现其导致αKG在细胞中积累,并伴随着肠上皮分化轨迹向分泌系偏移。该现象在小鼠类器官培养体系中同样得以验证:OGDH活性下降时,Muc2、Spdef等分泌细胞标志物显著上调,伴随肠道吸收细胞标志物(如Alpi)下调,说明αKG积累促使干细胞偏向分泌细胞谱系。
机制方面,作者进一步探讨了αKG如何具体影响细胞命运。αKG作为JmjC类组蛋白去甲基酶和TET DNA去甲基酶的辅助因子,参与调控组蛋白和DNA的甲基化状态。研究发现,在OGDH抑制导致αKG积累的条件下,分泌细胞谱系相关基因启动子区域(如Atoh1、Spdef)出现组蛋白去甲基化和DNA去甲基化现象,提示代谢物通过影响表观遗传状态介导转录程序的重编程。此外,通过ATAC-seq和ChIP-seq实验验证,OGDH下调与染色质开放度提升呈正相关,进一步支持代谢物驱动表观遗传状态改变从而指导细胞命运的观点。
在功能验证方面,研究团队在小鼠急性结肠炎模型中评估了OGDH调控在肠道再生中的作用。使用DSS诱导结肠损伤后,小鼠出现分泌细胞丧失和屏障功能受损的典型表型。给予OGDH抑制剂或外源补充αKG后,可观察到杯状细胞数量显著恢复,肠道上皮再生加速,炎症水平下降,提示调控OGDH-αKG轴可有效促进肠道上皮修复。该结论在另一种慢性肠道损伤模型中亦得到了验证。
综上所述,该研究系统地揭示了OGDH-αKG代谢轴在肠道干细胞谱系分化中的作用机制,明确αKG不仅作为TCA循环的关键中间产物,还通过调控表观遗传状态影响细胞命运选择。这一发现将代谢调控提升至细胞命运决定机制的核心地位,并为组织再生与炎症性肠病等疾病提供了可行的代谢干预策略。该研究不仅拓展了我们对代谢物在组织稳态与修复中作用的理解,也为未来开发代谢调控相关的再生医学治疗手段提供了坚实的理论基础。
参考文献:Chaves-Perez, A., Millman, S.E., Janaki-Raman, S. et al. Metabolic adaptations direct cell fate during tissue regeneration. Nature (2025). https://doi.org/10.1038/s41586-025-09097-6
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