摘要：

  尽管噬菌体作为治疗剂的地位一直被抗生素所掩盖，但多重耐药细菌的出现以及对肠道微生物群在人类健康和疾病中作用的更好理解使噬菌体重新成为人们关注的焦点。在这篇文章中，我们简要介绍了噬菌体的基本生物学特性，并总结了噬菌体在肠道微生物群和胃肠道疾病(如炎症性肠病和慢性肝病)中作用的最新发现。此外，我们回顾了噬菌体疗法治疗肠道疾病的临床前研究和临床试验，并探讨了当前的挑战和潜在的未来方向。

  前言：

  人类病毒组主要以细菌噬菌体(也称为噬菌体)为主，它是一种可以感染细菌的病毒。噬菌体在100年前被发现后，被广泛用作抗菌剂。在过去的几十年里，多重耐药菌的广泛出现减少了抗生素的实际用途。此外，对肠道微生物群与人类健康之间密切关系的新认知，使人们对广谱抗生素的普遍适用性提出了质疑。最后，现代分子遗传学、结构生物学和高通量基因组学揭示了噬菌体的高数量和多样性，能靶向大多数致病菌。

  在本文中，我们综述了噬菌体在维持人类健康和疾病发病机制中的作用，总结了噬菌体治疗方法的进展，包括直接使用噬菌体治疗肠道疾病，并讨论了通过靶向特定细菌物种来调控肠道微生物群。最后，我们讨论了噬菌体临床应用的挑战和未来潜在的研究方向。

  图1:健康人和炎症性肠病患者的肠道分泌物。炎症性肠病患者与健康人相比,其尾状病毒的相对丰度较高,与健康个体相比,尾状病毒家族的组成也不同。

  图2：噬菌体与肠道微生物群之间的关系。a噬菌体治疗克罗恩病。粘附侵袭性大肠杆菌刺激抗原呈递细胞(APCs)，驱动辅助性T细胞17(TH17)反应，引发慢性肠道炎症。靶向粘附侵袭性大肠杆菌的噬菌体被发现在结肠炎的临床前模型中是有益的。b噬菌体治疗酒精性肝炎。细胞溶素阳性E. faecalis从肠道转移到肝脏，通过分泌细胞溶素直接破坏肝细胞。在临床前模型中靶向细胞溶素阳性E. faecalis的噬菌体减少乙醇诱导的肝脏疾病。c噬菌体治疗结直肠癌。Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus (Sgg) 可上调β-连环蛋白，刺激细胞增殖，增加肠道炎症。噬菌体疗法可能是一种很有前景的治疗选择。

  图3：噬菌体的潜在应用。除了靶向它们的细菌宿主之外,噬菌体还可与人体相互作用，从而对人类健康和疾病产生多重影响。

  结论：噬菌体被用来防治细菌感染已经有一个多世纪了。肠道微生物群与人类疾病间关联的发现，重新引起了人们对这一研究领域的关注。噬菌体不仅是防治病原菌感染的有力武器，而且还能精确编辑肠道微生物群，对许多不同的胃肠道疾病都有良好的疗效。已经提出了多种治疗的可能性，但还需要更多的基础和临床前研究，以及合理设计的随机、双盲、安慰剂对照试验，以帮助该领域向前发展。该研究领域仍处于早期阶段，仍有许多重大问题和挑战有待解决，如潜在的噬菌体与人体相互作用的有利或有害影响，噬菌体作为重要生物实体的进化性质，以及噬菌体调控肠道微生物群对人类健康的长期影响。总之，噬菌体疗法有望成为治疗许多胃肠道和肠道外疾病的有效方法，值得更多的关注和进一步的探索。

  原文链接：https://www.nature.com/articles/s41575-021-00536-z