血清中HBV pgRNA标准化定量检测方法的建立
乙型肝炎病毒(HBV)感染是世界范围内的一个主要健康问题,世界上约30 %的人口表现出当前或过去HBV感染的血清学证据。尽管目前使用的抗病毒药物可以有效抑制慢性乙型肝炎(CHB)患者的HBV复制和疾病进展,但共价闭合环状DNA(cccDNA)仍难以根除。血清中的HBV RNA主要是非逆转录或部分逆转录前基因组RNA(pgRNA),并以HBV病毒颗粒样形式存在。而pgRNA只能由cccDNA产生,因此血清HBV pgRNA可作为HBV DNA的替代标志物,反映抗病毒治疗期间HBV DNA丢失时cccDNA的活性。同时,监测血清HBV RNA可预测抗病毒疗效,并可反映停药后HBV病毒反弹的风险。
血清HBV RNA由全长、剪接变体和3’端截短的pgRNA组成,甚至由超基因组长HBx RNA组成。前期研究发现,针对HBV基因组PreC/C、S或X区检测的血清HBV RNA水平不同,从PreC/C区、S区到X区逐渐降低。此外,2019年欧洲肝病学会(EASL)和美国肝病学会(AASLD)专家建议,血清HBV RNA的检测方法应标准化,且在检测时应明确HBV RNA的类型,如pgRNA、总RNA、剪接RNA或截短RNA。因此,为了优化血清HBV RNA的检测,需要阐明血清HBV RNA种类的动态变化及其对HBV RNA定量检测的影响。
今年3月,北京大学基础医学院鲁凤民教授团队在《Emerging Microbes & Infections》期刊发表题为“A standardized assay for the quantitative detection of serum HBV RNA in chronic hepatitis B patients”的研究文章。该研究证实了HBV RNA与HBeAg状态和NAs治疗无关,而pgRNA剪接变异体和3’端截短体影响血清HBV RNA的定量检测。

在这项研究中,首先检测了患者治疗前后血清pgRNA的动态变化,并通过三种RT-qPCR检测体系的设计评价了HBV pgRNA剪接变异体和3’端截短体对血清HBV RNA定量的影响,结果显示PreC/C-RNA在一定程度上可代表血清总HBV RNA的水平,SF-RNA检测体系只能扩增非剪接形式的HBV RNA,XR-RNA检测体系可以检测到X区存在的pgRNA。利用HBV RNA国家标准物质对三组体系的准确性和检测下限进行评估,结果显示PreC/C-RNA、SF-RNA和XR-RNA三种检测体系在对HBV RNA国家标准物质的定量检测中展现出明显不同的精确性和灵敏度(PreC/C-RNA>SF-RNA>XR-RNA)。为进一步探究不同疾病状态下血清pgRNA剪接体和截短体对HBV RNA定量检测的干扰,定量检测未接受抗病毒治疗的慢性HBV感染者血清HBV RNA水平。结果显示,无论是HBeAg阳性还是阴性,PreC/C-RNA的定量水平均显著高于SF-RNA和XR-RNA。最后,对接受NAs治疗后CHB患者的患者基线及血清HBV pgRNA进行定量检测,结果显示PreC/C-RNA水平均显著高于SF-RNA和XR-RNA。此外,部分CHB患者在SF-RNA和XR-RNA区域检测到的血清HBV RNA低于检测下限的时间早于PreC/C-RNA区域,说明在NAs抗病毒治疗下,PreC/C-RNA检测体系不仅拥有最高的灵敏度,并且可以降低假阴性率
总之,无论HBeAg状态如何、接受NAs治疗与否,pgRNA剪接变异体和3’末端截短体占总pgRNA的比例均足以影响血清HBV RNA的定量检测。该研究的出现将有助于我们更好地理解pgRNA剪接变体和3’末端截断,并进一步指导临床检测血清乙肝病毒RNA。
原文链接:https://doi.org/10.1080/22221751.2022.2045874
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