“菌”以群分，这下连朋友都没得做咯

近年来，越来越多的研究开始关注社会结构对个体及群体层面微生物组成和多样性的影响。当人们聚集互动时，无论是通过面对面的交流、共享食物还是共同的生活环境，他们的微生物群落都会相互交融，从而形成一个复杂的微生物社交网络。在人类社会中，家庭是微生物传播的重要场所。家庭成员之间通过共享食物、生活环境以及亲密的身体接触，促进了微生物在家庭内部的快速传播。除了家庭成员之间的微生物共享外，配偶间的微生物交换同样是一个不可忽视的传播途径。夫妻共同的生活方式和频繁的身体接触使得他们的微生物群落逐渐趋于相似。这些微生物的交换不仅丰富了群体间的微生物多样性，还可能对健康产生影响。尽管家庭内部和夫妻间的微生物传播已经得到了广泛的研究，但关于非血缘、非家庭成员间的微生物共享，尤其是通过社交网络的传播，目前的研究仍然较少。然而，随着社交媒体的普及和人们社交方式的多样化，非家庭关系的微生物共享现象可能变得越来越普遍。

2024年11月20日，耶鲁大学网络科学研究所Nicholas A. Christakis教授联合康奈尔大学生物医学工程系Ilana L. Brito教授在国际顶尖学术期刊《Nature》上发表了题为“Gut microbiome strain-sharing within isolated village social networks”的研究论文，该研究通过研究这些孤立村庄居民的肠道微生物组成与社交网络结构的关系，深入理解肠道微生物的传播机制，以及社交因素在微生物共享中的作用，为肠道微生物研究提供新的视角和思路。

该研究选取了洪都拉斯的18个相对隔绝的村庄作为研究对象，这些村庄的社交结构较为封闭，仅限于村内互动，村民们保持着传统的生活方式和饮食习惯，很少接触现代加工食品和抗生素等药物。通过对这些参与者的微生物组成、多样性以及菌株水平上的共享情况进行分析，发现菌株共享不仅局限于家庭内部，还扩展到了非家庭成员之间，包括朋友的朋友。研究还发现，社交中心的个体与整个村庄的微生物相似性更高，而社交边缘的个体则相对较低。此外，菌株共享模式在村庄内部显著，而不同村庄间的共享率较低，表明村庄环境对微生物分布有一定影响。社交中心的个体的微生物组成更能代表整个村庄的微生物群落，且与他们的一度关系者有较高的菌株共享率。通过使用Louvain聚类方法，研究在社交网络和微生物层面分别识别出集群，结果显示社交联系紧密的人群往往共享相似的微生物物种和菌株。在两个时间点（相隔约两年）对部分参与者进行的重复测量发现，已建立社交关系的个体间菌株共享率随时间增加。与未建立社交联系的个体相比，已建立联系的个体在后续时间点显示出更高的菌株共享率，且微生物传播主要发生在紧密的社交网络中，并随着社交距离的增加而逐渐减弱。

总之，该研究通过详细的社交网络映射和微生物测序数据，揭示了洪都拉斯孤立村庄中社交结构与肠道微生物组成之间的密切关系。研究结果证实，菌株共享不仅限于家庭内部，而是在社交网络中普遍存在，且社交中心的人与整个村庄的微生物相似性更高。此外，研究还发现社交地位、社交集群与微生物组成之间存在显著关联，以及微生物传播的社会距离效应。这些发现不仅丰富了我们对社交结构与微生物关系的认识，也为探索微生物在人类社会中的传播和演化提供了新的视角。同时，这些成果还为预防和治疗与肠道微生物相关的健康问题提供了创新的思路和方法。

原文链接：https://doi.org/10.1038/s41586-024-08222-1