当新手妈妈怀抱柔软的婴儿，用母乳哺育生命时，这份天然养料不仅提供了生长所需的蛋白质、脂肪和维生素，还藏着一套关乎宝宝长远健康的“微生物密码”。近年来，一项题为Assembly of the infant gut microbiome and resistome are linked to bacterial strains in mother’s milk的研究，就为我们揭开了母乳与婴儿肠道健康之间鲜为人知的紧密联系。

婴儿出生时，其肠道几乎是无菌的，而在出生后的几小时到几天内，大量微生物会迅速定植，逐渐构建起复杂的肠道微生物组。这个微生物“社区”就像肠道的“守护神”，不仅能帮助消化食物、合成必需营养素，还能调节免疫系统发育，抵御有害菌入侵。因此，肠道微生物组的早期构建质量，直接关系到婴儿的短期健康（如减少腹泻、过敏风险）和长期健康（如降低成年后肥胖、糖尿病等慢性疾病的概率）。在过去，科学家们多认为分娩方式、辅食添加等是影响婴儿肠道菌群定植的关键因素，而母乳的作用更多聚焦在营养供给上。但随着研究的深入，人们发现母乳中并非“无菌”，而是含有丰富的细菌菌株，这些菌株是否会参与婴儿肠道微生物组的构建？与此同时，肠道中还存在着“耐药基因组”，即微生物体内携带的耐药基因集合，它们可能会影响抗生素的疗效，甚至引发耐药菌感染风险。婴儿肠道耐药基因组的来源又是什么？这些问题都亟待科学解答，而该研究正是围绕这些核心疑问展开。

该研究基于美国明尼阿波利斯的 “母亲与婴儿健康关联（MILk）” 队列，共纳入195对健康母婴，通过标准化流程采集并分析507个宏基因组样本。在研究方法上，团队采用了两种关键技术：一是宏基因组测序技术，通过对母乳样本和婴儿粪便样本中的微生物DNA进行全面测序，精准识别其中的细菌种类、菌株信息以及耐药基因的类型和数量；二是菌株水平的溯源分析，利用特定的基因标记，像“指纹识别”一样，追踪母乳中的细菌菌株是否能成功进入婴儿肠道并定植。同时，研究团队还收集了母婴的基本信息（如分娩方式、喂养模式、是否使用过抗生素等），以排除其他因素的干扰。

研究通过对母婴配对样本的宏基因组测序分析发现，长双歧杆菌是驱动母乳与婴儿肠道菌群分类学重叠的核心物种，且由其主导的婴儿肠道菌群表现出更高的时序稳定性，而剖宫产会降低菌株在肠道的持久性。该研究鉴定了12例母婴菌株共享事件，涉及长双歧杆菌等共生菌及肺炎克雷伯菌等条件致病菌，且发现唾液链球菌等口腔菌可能通过“逆流”由婴儿传播至母乳。该研究还发现，一月龄婴儿肠道微生物组显著富集必需氨基酸和核糖核苷酸的从头生物合成通路，表明早期定植菌群在代谢功能上具有较高的独立性，而母乳菌群功能更侧重于核苷酸合成。

在耐药基因组层面，研究首次明确婴儿肠道内的部分耐药基因与母乳菌株携带的耐药基因具有高度同源性，证实母乳是婴儿肠道耐药基因的重要来源之一。但并非所有耐药基因都存在健康风险，其中多数为天然耐药基因，不会导致临床耐药性问题；仅少数与抗生素使用相关的获得性耐药基因，在特定条件下可能存在潜在风险。同时研究还发现母乳与婴儿肠道共享包括针对大环内酯类、四环素等抗生素的耐药基因（ARG），且在存在菌株共享的母婴对中ARG重叠率最高，同时双歧杆菌丰度较低的婴儿携带更多耐药基因。

本研究对195对母婴的507个纵向宏基因组样本进行深度测序，揭示母乳微生物组在塑造婴儿早期肠道菌群组装及抗生素耐药组中的作用。研究发现母乳通过菌株水平的垂直传播和耐药基因共享，显著影响婴儿肠道微生物的物种组成、时间稳定性及功能代谢潜能。对新手父母而言，这项研究为“坚持母乳喂养”提供了新的科学支撑。它打破了“母乳只提供营养”的认知，让我们看到母乳作为“活的养料”，其含有的菌株是给宝宝的“健康启动包”。这意味着在条件允许时，纯母乳喂养不仅是营养选择，更是为宝宝肠道菌群“奠基”的关键举措，无需盲目依赖额外的益生菌补充剂。同时，“多数耐药基因安全”的结论，也能缓解家长的焦虑，避免因过度担忧而放弃母乳喂养。

参考文献：Pamela Ferretti, Mattea Allert, Kelsey E Johnson, et al. Assembly of the infant gut microbiome and resistome are linked to bacterial strains in mother's milk. Nature Communications.2025-11-22;doi:10.1038/s41467-025-66497-y.