以幽门螺杆菌感染为胃癌的原因是一个全球公共卫生问题。除了保护细菌免受抗生素侵害外，生物膜还会降低幽门螺杆菌根除疗法的疗效。研究纳入了来自孟加拉国患者的19例幽门螺杆菌分离株。结晶紫测定用于量化生物膜量，并将菌株分为高和低生物膜形成株，其中6.81%高生物膜形成株和4.4%低生物膜形成株。这些表型与系统发育分析中的特定分支无关。从全基因组序列中提取并分析与生物膜相关的辅助基因。

  孟加拉国幽门螺杆菌菌株生物膜形成的分布

  定量生物膜形成并将其分为两组：使用结晶紫测定法测定高和低生物膜形成株。高生物膜形成株组包括19.6%的菌株(11/56)，平均光密度(OD)为0.85(SD 0.4)。低生物膜形成者的分布为80.4%(45/56)，平均OD为0.24(SD 0.06)。

  生物膜形成者之间的系统发育相似性

  使用最大似然算法推断的系统发育树来评估生物膜形成表型与不同遗传幽门螺杆菌谱系之间的关联。高生物膜在进化枝中零星分布;因此，没有特定的系统发育分支与生物膜的形成有关。

  与生物膜形成相关的突变体

  分析SNP以找出与生物膜形成相关的机制(除了基因缺失)。该管道根据参考文献中的序列ATCC 26695组装基因，该菌株具有低生物膜形成。用MAF>10%分析提取的多态性总数为960，包括移码、插入、缺失、多位点多态性和单核苷酸多态性。

  参考文献：Fauzia, K.A., Aftab, H., Miftahussurur, M. et al. Genetic determinants of Biofilm formation of Helicobacter pylori using whole-genome sequencing. BMC Microbiol 23, 159 (2023). https://doi.org/10.1186/s12866-023-02889-8