New Phytologist 真菌生态位被低估了：红菇的“菌根—内生”双重身份

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来源：新植物学家

2026-04-29 15:07:26

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核心提示：红菇属真菌可能同时拥有“外生菌根+内生”两种生态身份

外生菌根真菌（Ectomycorrhizal fungi, EcMF）通常被视为树木根系的“地下搭档”。这篇论文却提出一个更有冲击力的问题：它们会不会也悄悄进入不形成外生菌根的草本植物根中？

答案是：会，而且红菇属真菌可能同时拥有“外生菌根+内生”两种生态身份。

1｜研究结果是什么

作者追问：EcMF能否真正进入非外生菌根植物根内生活？他们在法国9个地点、66种植物中采样，先用真菌测序寻找EcMF信号，再用显微方法直接观察红菇属（Russula）菌丝。结果发现，EcMF在许多非EcM植物根中都能检测到，且靠近EcM树木时更常见；其中Russula还被证实以活跃菌丝状态进入两种草本植物根的细胞间隙，说明它确实占据了双生态位。

2｜研究方法是什么

第一步：在自然环境中做大范围采样

作者在法国森林、林缘和草地共9个地点取样，覆盖433株植物、557份根样、66种非EcM植物。
这样做是为了先回答：这种现象到底普遍不普遍，而不是某个地点的偶然发现。

第二步：先用测序锁定“谁在根里”

研究者扩增真菌核糖体内转录间隔区2（Internal transcribed spacer 2, ITS2），并将序列聚类为操作分类单元（Operational Taxonomic Units, OTUs）。
随后严格去除低质量序列和潜在污染，筛出可信的EcMF信号。

第三步：比较根际和根内，排除“只是沾上去”

作者把根际和根内部的真菌群落成对比较。
结果显示，EcMF在根际里更多，但根际与根内的EcMF组成并未显著分开，说明这不是简单的土壤残留，而是真有一部分EcMF进入了根内。

第四步：分析哪些因素在决定进入

作者用置换多元方差分析（Permutational multivariate analysis of variance, PERMANOVA）等方法比较地点和植物身份差异。
结果表明：森林和林缘高于草地，靠近EcM树木更容易出现EcMF；不同植物也有不同“开放程度”。

第五步：用显微证据把结论坐实

作者专门为Russula设计荧光原位杂交（Fluorescence in situ hybridization, FISH）探针，靶向18S核糖体RNA（18S ribosomal RNA, 18S rRNA），再结合共聚焦显微镜观察。
最终在两种草本植物根中看到Russula菌丝：多数在根表，少数进入皮层细胞间隙；信号位于菌丝细胞质，说明它们是活的、代谢活跃的，且未引起明显病变，更符合无症状内生。

方法主线：作者先用大样本测序证明EcMF常出现在草根中，再用根际对照排除假信号，最后用FISH直接证明Russula活着进入草本植物根内。